Vliv pH a doby akumulace na elektrochemické chování krátkých hetero-oligonukleotidů

• Autoři: MIKELOVÁ Radka; TRNKOVÁ Libuše; JELEN František; ROZIK Roland
• Rok publikování: 2006
• Druh: Článek ve sborníku
• Konference: XXVI. Moderní elektrochemické metody
• Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta
• Obor: Elektrochemie
• Klíčová slova: Electrochemistry; Hetero-oligonucleotides; Mercury electrode; Elimination voltammetry with linear scan
• Popis: Nedávno byla eliminační voltametrie s lineární polarizací (EVLS Elimination Voltammetry with Linear Scan) úspěšně použita k analýze voltametrických dat krátkých syntetických oligodeoxynukleotidů (ODNs), které obsahovaly redukovatelné báze: adenin (A) a cytosin (C). V případě homo-ODNs se jednalo o devítimery dA9 a dC9 a jejich směsi, v případě hetero-ODNs o devítimery se stejným poměrem (C/A=3/1), ale s rozdílnou sekvencí bází. Redukční procesy obou bází jsou si na rtuťové elektrodě potenciálově velmi blízké, odpovídající píky C a A se překrývají a běžné voltametrické metody nám dovolují na svých záznamech pozorovat pouze jejich jediný signál. Jedině EVLS byla schopná tyto dva překrývající se signály rozdělit a registrovat. Jelikož se detekce a separace píků C a A podstatně zvýší díky adsorpci, byla EVLS kombinována s adsorptivním nahromaděním elektroaktivní částice na povrchu elektrody AdS EVLS. Bylo zjištěno, že voltametrické signály jsou velmi závislé na pH a na době akumulace. Naše práce se zaměřila na studium vlivu těchto dvou parametrů na AdS EVLS signály výše zmíněných hetero-ODNs. Závěr V práci byla předložena detekční metoda ODNs založená na spojení dvou procedur, adsorpční rozpouštěcí voltametrie (AdSV - Adsorptive Stripping Voltammetry) a eliminační voltametrie s lineární polarizací elektrody (EVLS - Elimination Voltammetry with Linear Scan). Bylo ukázáno, že AdS EVLS dovede nejen kvantifikovat daný ODN pomocí poměru A/C, ale i kvalitativně rozlišit změny v primární struktuře nukleotidů v ODN řetězci a pravděpodobně i v následných změnách sekundární a terciární struktury ODNs . Dokonce se dá očekávat, že v případě identického počtu bází bude tento nový nástroj schopen rozlišit spolu sousedící či nesousedící sledované báze. AdS EVLS lze považovat jako nový nástroj pro kvalitativní a kvantitativní analýzu ODNs.

Související projekty

• Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální , regionální a lokální úrovni
• Nové přístupy v elektrochemické analýze nukleových kyselin a oligonukleotidů zaměřené na ultrasensitivní mikrodetekci DNA a detekci DNA hybridizace
• Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu