New isolate of Photorhabdus luminescens ssp. kayaii from the Czech Republic

• Název česky: Nový izolát Photorhabdus luminescens ssp. kayaii z České republiky
• Autoři: HYRŠL Pavel; PÁČOVÁ Zdenka; SEDLÁČEK Ivo
• Rok publikování: 2006
• Druh: Konferenční abstrakty
• Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta
• Popis: Izolovali jsme symbiotické bakterie z entomopatogenní hlístovky druhu Heterorhabditis bacteriophora H221 (Pouzdřany). Izolát Photorhabdus sp. CCM 7002 vykazoval jasnou bioluminiscenci, která je charakteristická pro rod Photorhabdus. Proto byl náš izolát srovnáván s typovými kulturami všech druhů rodu Photorhabdus (P. asymbiotica ssp. asymbiotica, P. asymbiotica ssp. australis, P. luminescens ssp. akhurstii, P. luminescens ssp. kayaii, P. luminescens ssp. laumondii, P. luminescens ssp. luminescens, P. luminescens ssp. thracensis, P. temperata). Fenotypová charakteristika byla založena na identifikačních kitech(API 50 CH, API 20 NE, ENTEROtest 24) společně s konvenčními identifikačními testy. Nejpodobější našemu izolátu Photorhabdus sp. CCM 7002 byl na základě 98 charakteristik P. luminescens. Proteinové spektrum bakterií bylo determinováno akrylamidovou gradientovou elektroforézou (SDS-PAGGE). Nalezli jsme více než 40 proteinových frakcí v rozmezí 6.5 - 200 kDa. Na základě této metody jsou jasně odlišitelné jednotlivé druhy rodu Photorhabdus. Nakonec použitím 16S rRNA genové sekvence byla prokázána 100 % shoda s P. luminescens ssp. kayaii, který byl popsán na základě dvou izolátů z Turecka v roce 2004. Náš izolát Photorhabdus sp. CCM 7002 je prvním izolátem tohoto poddruhu v České republice možná také druhým izolátem celosvětově. This study was supported by grant MSM0021622416.

Související projekty

• Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase