Cations and Hydration in Catalytic RNA: Molecular Dynamics of the Hepatitis Delta Virus Ribozyme

• Název česky: Kationty a hydratace v katalyticke RNA: Molekulová dynamika ribozymu Hepatitis Delta viru
• Autoři: KRASOVSKA Maryna; SEVCIKOVA Jana; REBLOVA Kamila; SCHNEIDER Bohdan; NILS Walter; SPONER Jiri
• Rok publikování: 2006
• Druh: Článek v odborném periodiku
• Časopis / Zdroj: Biophysical Journal
• Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta
• Obor: Biofyzika
• Klíčová slova: molecular dynamics simulations; ribozyme; hydration; cations
• Popis: Detailní analýza kovových (monovalentní a divalentních) iontu a hydratce ve strukture HDVr behem celkových 200 ns simulace. Popis významných vazebných míst, výpocet elstat. potenciálu a celkové dynamiky systému.

Související projekty

• Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím