Testování kandidátních lokusů pro typizaci klinických izolátů Treponema pallidum.

• Autoři: MATĚJKOVÁ Petra; FLASAROVÁ Magdalena; ŠMAJS David; WOZNICOVÁ Vladana
• Rok publikování: 2007
• Druh: Článek ve sborníku
• Konference: XI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků.
• Fakulta / Pracoviště MU: Lékařská fakulta
• Obor: Genetika a molekulární biologie
• Klíčová slova: Candidate loc; clinical testing; Treponema pallidum.
• Popis: Bylo provedeno pilotní testování lokusů potenciálně využitelných k typování PCR pozitivních vzorků klinického materiálu syfilitických pacientů. Testované lokusy byly vybrány na základě mapování heterologních úseků mezi kmeny Nichols, SS14 (syfilitické kmeny) a Samoa D (kmen yaws) s využitím metody komparativní genomové sekvenace. Jednalo se o hypotetické geny TP0136 a TP0548 v genomu T. pallidum subsp. pallidum kmene Nichols. Bylo provedeno srovnání sekvencí těchto genů v klinickém materiálu s typovými kmeny T. pallidum poddruhů pallidum, pertenue a endemicum.

Související projekty

• Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
• Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
• Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum