PCR diagnostika a molekulární typizace původce syfilis: aktuální problémy PCR detekce.

• Autoři: ŠMAJS David
• Rok publikování: 2007
• Druh: Konferenční abstrakty
• Fakulta / Pracoviště MU: Lékařská fakulta
• Popis: Komparativní genomika patogenních spirochet odhalila chromosomální oblasti původce syfilis, Treponema pallidum ssp. pallidum, které jsou variabilní v několika vyšetřených kmenech tohoto poddruhu a které jsou ohraničeny konzervovanými sekvencemi. Zavedli jsme metodu detekce chromosomální DNA T. p. pallidum dvoukrokovou (nested) PCR reakcí, která amplifikuje část genu TP0319 (tmpC), kódujícího hypotetický membránový lipoprotein. PCR amplifikace a sekvenování DNA genů TP0136 a TP0548 z pozitivních vzorků prokázalo výskyt jak kmenů sekvenčně identických s kmenem T. p. pallidum SS14, tak také unikátních syfilitických kmenů, doposud u T. p. pallidum nepopsaných. Aktuální problémy PCR detekce T. p. pallidum v klinickém materiálu zahrnující zejména výběr a odběr klinických vzorků, jejich transport a zpracování. Pokroky v molekulární typizaci T. p. pallidum v klinickém materiálu přispějí k rozvoji epidemiologie syfilis a přinesou možnosti rozlišení mezi reinfekcí a reaktivací syfilitického procesu.

Související projekty

• Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
• Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
• Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum