Informace o publikaci
Využití rep-PCR v bakteriální taxonomii
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2007 |
| Druh | Konferenční abstrakty |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Popis | Metody rep-PCR (repetitive sequence-based PCR) jsou založeny na shlukové analýze PCR produktů získaných s primery komplementárními ke krátkým repetitivním sekvencím, které jsou rozšířeny v genomech prokaryot. V bakteriální taxonomii jsou nejčastěji využívány primery komplementární k sekvencím ERIC, REP, BOX a (GTG)5. Tyto metody našly uplatnění jak pro identifikaci, tak pro vnitrodruhovou typizaci širokého spektra grampozitivních i gramnegativních bakterií. Vzhledem k jednoduchosti provedení, dobré reprodukovatelnosti, časové nenáročnosti a nízké ceně jsou rep-PCR metody velmi vhodné nejen pro identifikaci jednotlivých kmenů, ale rovněž pro rychlou a spolehlivou diferenciaci početných skupin izolátů. Na pracovišti České sbírky mikroorganismů (PřF MU) byla doposud využita především (GTG)5-PCR pro identifikaci mléčných bakterií (např. enterokoky, laktobacily, laktokoky, streptokoky) a ERIC-PCR pro typizaci zástupců rodu Aeromonas. Podpořeno projektem MSM 0021622416. |
| Související projekty: |