Trans Hoogsteen/Sugar Edge Base Pairing in RNA. Structures, Energies, and Stabilities from Quantum Chemical Calculations

• Název česky: Trans Hoogsteen/Sugar Edge párování v RNA. Struktura, energie a stabilita z kavntově chemických výpočtů
• Autoři: MLÁDEK Arnošt; SHARMA Purshotam; MITRA Abhijit; BHATTACHARYYA Dhananjay; ŠPONER Jiří; ŠPONER Judit
• Rok publikování: 2009
• Druh: Článek v odborném periodiku
• Časopis / Zdroj: Journal of Physical Chemistry B
• Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta
• Obor: Biofyzika
• Klíčová slova: quantum chemistry; base pairing; RNA
• Popis: Trans Hoogsteen/sugar edge (H/SE) RNA páry bází formují jednu z 6 rodin párů RNA, která využívá 2hydroxylovou skupinu na ribóze pro párování, a hrají důležitou roli při stabilizaci zfoldovaných molekul RNA. V této práci popisujeme pomocí kvantové chemie charakteristické struktury a interakční energie této rodiny spolu s vyhodnocením stínících efektů pomocí přístupu spojitého solventu.

Související projekty

• Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
• Biomolekulární centrum