Molecular and cytogenetic analysis of the biggest plant genomes

• Název česky: Molekulární a cytogenetická analýza největších rostlinných genomů
• Autoři: AMBROŽOVÁ Kateřina; MACAS Jiří; NEUMANN Pavel; LEITCH Ilia J.; LYSÁK Martin
• Rok publikování: 2009
• Druh: Konferenční abstrakty
• Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta
• Popis: Rod Fritillaria obsahuje druhy s největším doposud známým genomem a zároveň poskytuje obrovskou vnitrodruhovou variabilitu týkající se velikosti genomu (30,000-127,000 Mb/C) spolu s až překvapivou uniformitou karyotypu. Tento rod je znám bikontinentální distribucí a obě větve ukazují nezávislou tendenci zvětšovat velikost genomu. Ze satelitních sekvencí jsme popsali velmi nehomogenní AT-bohatou satelitní repetitivní sekvenci reprezentující významnou část heterochromatinových oblastí na chromozomech u druhů severoamerických, ale nevyskytující se u eurasijských druhů rodu Fritillaria. Abychom byli schopni identifikovat také rozptýlené repetitivní elementy, bylo sekvenováno a následně charakterizováno přes 140 kb od jednoho druhu z každé větve (s přibližně podobnou velikostí genomu): Fritillaria imperialis (Eurasie) a F. affinis (Severní Amerika). Prozatím jsme pozorovali, že procentuální podíl různých tříd repetitivních elementů se mezi danými modelovými druhy významně neliší a zároveň byly jako dominantní elementy genomů modeových druhů rodu Fritillaria identifikovány retrotranspozony typu Ty3/gypsy.

Související projekty

• Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
• Molekulární a cytogenetická analýza gigantických genomů rodu Fritillaria (Liliaceae)