Quantification of retrotransposons in Eleocharis using degenerate real-time PCR

• Název česky: Kvantifikace retrotranspozonů v rodě Eleocharis pomocí degenerované real-time PCR
• Autoři: ZEDEK František; ROTREKLOVÁ Olga; HOROVÁ Lucie; ŠMERDA Jakub; BUREŠ Petr
• Rok publikování: 2009
• Druh: Konferenční abstrakty
• Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta
• Popis: Rod Eleocharis (Cyperaceae) zahrnuje asi 200 druhů. Z karyologického hlediska má Eleocharis mezi ostatními rostlinami unikátní postavení. Zástupci rodu Eleocharis se významě liší ve velikostech genomu (od 0,42 pg u Eleocharis cellulosa do 9 pg u E. uniglumis subsp. sterneri) a průměrných velikostech chromozómů (od asi 2 Mbp u E. cellulosa fo 299 Mbp u E. xyridiformis). Velikost genomu a průměrná velikost chromozómů vzrůstá s fylogenetickou odvozeností druhů rodu Eleoharis. Tato studie se zaměřuje na roli retrotranspozonů v tomto trendu.

Související projekty

• Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase
• Centrum pro výzkum biodiverzity