Informace o publikaci
Dynamics of the base of ribosomal A-site finger revealed by molecular dynamics simulations and Cryo-EM.
| Název česky | Dynamika ribosomálního A-site fingeru odhalená molekulově dynamickými simulacemi a Cryo-EM. |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2010 |
| Druh | Článek v odborném periodiku |
| Časopis / Zdroj | Nucleic Acids Research |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Fyzikální chemie a teoretická chemie |
| Klíčová slova | Kink-turn; RNA flexibility; Molecular Dynamics; Ribosome function |
| Popis | Provedli jsme molekulově dynamické simulace ohnutých segmentů A-site fingeru z velké podjednotky archeálního ribozómu a ze třech velkých podjednotek ribozómů bakteriálních. Studie ukázala, že ačkoli mají studované ribozomální segmenty nekonzervované sekundární struktury, mají téměř identické prostorové uspořádání a vykazují podobné stochastické fluktuace. Geometrie segmentů ze simulací odpovídají strukturám, které byly získány pomocí kryo-elektronové mikroskopie. |
| Související projekty: |