Informace o publikaci

New path planning method for computation of constrained dynamic channels in proteins

Autoři

BENEŠ Petr STRNAD Ondřej SOCHOR Jiří

Rok publikování 2011
Druh Článek ve sborníku
Konference WSCG Full papers proceedings
Fakulta / Pracoviště MU

Fakulta informatiky

Citace
www http://wscg.zcu.cz/WSCG2011/!_2011_WSCG_Full_papers.pdf
Obor Informatika
Klíčová slova protein; path planning; collision-free path; constrained dynamic channel
Popis Bezkolizní cesty v geometrickém modelu molekuly proteinu odkrývají různé závislosti mezi strukturou a funkcí molekuly. Cesty spojující biochemicky důležité části uvnitř proteinu s povrchem mohou sloužit jako vstupní nebo výstupní cesty pro malé molekuly (substráty), které mohou v těchto důležitých částech zreagovat a tím i změnit funkci celého proteinu. Geometrický plánovací algoritmus prezentován v tomto článku byl navržen pro hledání cest v prostředí hustě pokrytém sférickými pohybujícími se překážkami. Ukázková implementace řeší výpočet bezkolizních cest v molekulárním prostředí. Na algoritmus jsou kladeny další omezující podmínky např. časová souslednost průchodu robota. Algoritmus byl testován na reálných datech a z výsledků můžeme konstatovat, že pokud byla cesta v datech přítomna, náš algoritmus ji úspěšně detekoval.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info