Informace o publikaci

Computation of Dynamic Channels in Proteins

Logo poskytovatele
Logo poskytovatele
Autoři

BENEŠ Petr MEDEK Petr STRNAD Ondřej SOCHOR Jiří

Rok publikování 2011
Druh Článek ve sborníku
Konference Proceedings of Biotechno
Fakulta / Pracoviště MU

Fakulta informatiky

Citace
Obor Informatika
Klíčová slova protein; dynamic channel; molecule; trajectory; computational geometry
Popis Prezentujeme novou metodu pro detekci tzv. dynamických tunelů v trajektorii molekulární dynamiky. Metoda využívá základních principů výpočetní geometrie a je založena na maximalizaci volného prostoru uvnitř molekuly. Dynamické tunely zvýrazňují pulsující a flexibilní části molekuly a umožňují ligandu vstoupit do aktivního místa molekuly. Metoda byla testována na skutečných datech a výsledky přináší dosud nepoznané informace o molekule.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info