Informace o publikaci
Computation of Dynamic Channels in Proteins
Autoři | |
---|---|
Rok publikování | 2011 |
Druh | Článek ve sborníku |
Konference | Proceedings of Biotechno |
Fakulta / Pracoviště MU | |
Citace | |
Obor | Informatika |
Klíčová slova | protein; dynamic channel; molecule; trajectory; computational geometry |
Popis | Prezentujeme novou metodu pro detekci tzv. dynamických tunelů v trajektorii molekulární dynamiky. Metoda využívá základních principů výpočetní geometrie a je založena na maximalizaci volného prostoru uvnitř molekuly. Dynamické tunely zvýrazňují pulsující a flexibilní části molekuly a umožňují ligandu vstoupit do aktivního místa molekuly. Metoda byla testována na skutečných datech a výsledky přináší dosud nepoznané informace o molekule. |
Související projekty: |