Development of a Crystallization Protocol for the DbeA1 Variant of Novel Haloalkane Dehalogenase from Bradyrhizobium elkani USDA94

• Název česky: Vývoj krystalizace protokolu pro DbeA1 Variant nových dehalogenázy Haloalkane z Bradyrhizobium elkani USDA94
• Autoři: PRUDNIKOVA Tanyana; CHALOUPKOVÁ Radka; SATO Yukari; NAGATA Yuji; DEGTJARIK O.; KUTÝ Michal; REZACOVA P.; DAMBORSKÝ Jiří; KUTA-SMATANOVÁ Smatanova I.
• Rok publikování: 2011
• Druh: Článek v odborném periodiku
• Časopis / Zdroj: Crystal Growth & Design
• Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta
• Doi: http://dx.doi.org/10.1021/cg1013363
• Obor: Biochemie
• Klíčová slova: Crystallization; X-ray;Haloalkane dehalogenases
• Popis: The DbeA1 variant of a novel haloalkane dehalogenaseDbeA (EC 3.8.1.5) from Bradyrhizobium elkani USDA94 was constructed to study the structure-function relationships between DbjA and DbeA enzymes. A DbeA1 variant carries a unique fragment of nine amino acids transplanted from the sequentially closely related enzyme DbjA from Bradyrhizobium japonicum USDA110 to DbeA. Here we report development of the crystallization protocol for DbeA1 and soaking experiments with the ligands 1-fluoropentane and 1,3-dichloropropane.

Související projekty

• Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
• Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální , regionální a lokální úrovni
• Evoluce substrátové specifity u enzymů aktivních s xenobiotickými látkami
• Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí