Informace o publikaci

Computation and Visualization of Surface of Proteins and their Channels

Logo poskytovatele
Název česky Počítání a vizualizace povrchu proteinů a jejich tunelů
Autoři

KOZLÍKOVÁ Barbora ALEKSANDROWICZ Igor SOCHOR Jiří

Rok publikování 2011
Druh Článek ve sborníku
Konference The IADIS Computer Graphics, Visualization, Computer Vision and Image Processing (CGVCVIP) 2011
Fakulta / Pracoviště MU

Fakulta informatiky

Citace
Obor Informatika
Klíčová slova surface; protein; channel; visualization
Popis V tomto článku představujeme náš přístup k výpočtu povrchu molekul. Výzkumníci se tímto složitým problémem zabývají již mnoho let a během této doby bylo navrženo mnoho možných řešení. Náš algoritmus vychází z obecně známého přístupu zvaného redukované povrchy, avšak naše řešení zavádí četná vylepšení a zjednodušení, zejména ve fázích, kdy je třeba řešit problémy vznikající při generování redukovaných povrchů. Vše je navrženo s ohledem na skutečnost, že nově implementovaný algoritmus by měl sloužit nejen na zobrazení molekulárních povrchů, ale rovněž pro generování povrchu takzvaných tunelů, což jsou specifické struktury nacházející se uvnitř proteinů. Výsledný algoritmus se rovněž stal součástí komplexní aplikace CAVER Viewer, která byla navržena zejména pro možnost detekce, vizualizace a následného prozkoumání spočtených tunelů.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info