Project information
Role mesopolyploidie v evoluci celedi Brassicaceae

Investor logo
Project Identification
GA13-10159S
Project Period
2/2013 - 12/2015
Investor / Pogramme / Project type
Czech Science Foundation
MU Faculty or unit
Central European Institute of Technology

Celogenomové duplikace (polyploidie) hrají u rostlin klícovou roli pri vzniku genetické diversity. Na rozdíl od paleopolyploidie, evolucne mladší mesopolyploidní duplikace jsou detekovatelné pomocí srovnávací cytogenetiky a genomiky. Naše predbežná
cytogenetická analýza bona fide diploidních druhu ukázala, že v cel. Brassicaceae se vyskytlo nekolik mesopolyploidních duplikací. Cílem projektu je identifikovat a charakterizovat mesopolyploidní duplikace v cel. Brassicaceae pomocí srovnávacího
malování chromosomu a sekvencní analýzy transkriptomu. Budou rekonstruovány ancestrální subgenomy mesopolyploidních taxonu, stejne jako proces genomové diploidizace. Dále budou zkoumány prestavby karyotypu duplikovaných genomu a mechanismy redukce poctu chromosomu u quasi-diploidních druhu. Sekvencní analýza celogenomového transkriptomu bude použita k potvrzení cytogenetických dat a k analýze fylogenetické pozice celogenomových duplikací. Bude testováno zda
mesopolyploidní duplikace mely prímý impakt na adaptivní radiaci a druhovou rozmanitost mesopolyploidních taxonu.

Publications

Total number of publications: 3


You are running an old browser version. We recommend updating your browser to its latest version.

More info