Project information
Role mesopolyploidie v evoluci celedi Brassicaceae
- Project Identification
- GA13-10159S
- Project Period
- 2/2013 - 12/2015
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
Celogenomové duplikace (polyploidie) hrají u rostlin klícovou roli pri vzniku genetické diversity. Na rozdíl od paleopolyploidie, evolucne mladší mesopolyploidní duplikace jsou detekovatelné pomocí srovnávací cytogenetiky a genomiky. Naše predbežná
cytogenetická analýza bona fide diploidních druhu ukázala, že v cel. Brassicaceae se vyskytlo nekolik mesopolyploidních duplikací. Cílem projektu je identifikovat a charakterizovat mesopolyploidní duplikace v cel. Brassicaceae pomocí srovnávacího
malování chromosomu a sekvencní analýzy transkriptomu. Budou rekonstruovány ancestrální subgenomy mesopolyploidních taxonu, stejne jako proces genomové diploidizace. Dále budou zkoumány prestavby karyotypu duplikovaných genomu a mechanismy redukce poctu chromosomu u quasi-diploidních druhu. Sekvencní analýza celogenomového transkriptomu bude použita k potvrzení cytogenetických dat a k analýze fylogenetické pozice celogenomových duplikací. Bude testováno zda
mesopolyploidní duplikace mely prímý impakt na adaptivní radiaci a druhovou rozmanitost mesopolyploidních taxonu.
Publications
Total number of publications: 3
2017
-
Diverse genome organization following 13 independent mesopolyploid events in Brassicaceae contrasts with convergent patterns of gene retention
Plant Journal, year: 2017, volume: 91, edition: 1, DOI
2016
-
Repeated Whole-Genome Duplication, Karyotype Reshuffling, and Biased Retention of Stress-Responding Genes in Buckler Mustard
Plant Cell, year: 2016, volume: 28, edition: 1, DOI
2015
-
A time-calibrated road map of brassicaceae species radiation and evolutionary history
The Plant Cell, year: 2015, volume: 27, edition: 10, DOI