Informace o projektu
Role mesopolyploidie v evoluci celedi Brassicaceae
- Kód projektu
- GA13-10159S
- Období řešení
- 2/2013 - 12/2015
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
Celogenomové duplikace (polyploidie) hrají u rostlin klícovou roli pri vzniku genetické diversity. Na rozdíl od paleopolyploidie, evolucne mladší mesopolyploidní duplikace jsou detekovatelné pomocí srovnávací cytogenetiky a genomiky. Naše predbežná
cytogenetická analýza bona fide diploidních druhu ukázala, že v cel. Brassicaceae se vyskytlo nekolik mesopolyploidních duplikací. Cílem projektu je identifikovat a charakterizovat mesopolyploidní duplikace v cel. Brassicaceae pomocí srovnávacího
malování chromosomu a sekvencní analýzy transkriptomu. Budou rekonstruovány ancestrální subgenomy mesopolyploidních taxonu, stejne jako proces genomové diploidizace. Dále budou zkoumány prestavby karyotypu duplikovaných genomu a mechanismy redukce poctu chromosomu u quasi-diploidních druhu. Sekvencní analýza celogenomového transkriptomu bude použita k potvrzení cytogenetických dat a k analýze fylogenetické pozice celogenomových duplikací. Bude testováno zda
mesopolyploidní duplikace mely prímý impakt na adaptivní radiaci a druhovou rozmanitost mesopolyploidních taxonu.
Publikace
Počet publikací: 3
2017
-
Diverse genome organization following 13 independent mesopolyploid events in Brassicaceae contrasts with convergent patterns of gene retention
Plant Journal, rok: 2017, ročník: 91, vydání: 1, DOI
2016
-
Repeated Whole-Genome Duplication, Karyotype Reshuffling, and Biased Retention of Stress-Responding Genes in Buckler Mustard
Plant Cell, rok: 2016, ročník: 28, vydání: 1, DOI
2015
-
A time-calibrated road map of brassicaceae species radiation and evolutionary history
The Plant Cell, rok: 2015, ročník: 27, vydání: 10, DOI