Project information
Genomová variabilita treponem během experimentální infekce
- Project Identification
- GP14-29596P
- Project Period
- 1/2014 - 12/2016
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Postdoctoral projects
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Medicine
- Mgr. Michal Strouhal, Ph.D.
Rod Treponema zahrnuje bakteriální druhy a poddruhy, které jsou obligátními patogeny lidí a zvířat a pro které je charakteristická různá míra patogenity a hostitelské specifity a obecná nemožnost jejich kultivace za podmínek in vitro. Pro tyto bakterie je charakteristická také schopnost uniknout imunitnímu systému příslušného hostitele a tato schopnost je dávána do souvislosti s genomovou variabilitou příslušného treponemálního kmene. Detekce variabilních míst na úrovni příslušného treponemálního kmene tak může vést k většímu porozumění mechanizmů patogeneze treponemálních onemocnění. V této práci navrhujeme identifikovat variabilní úseky v genomech vybraných treponemálních kmenů na základě in silico analýzy dostupných sekvenačních dat, dále charakterizovat vnitrokmenovou variabilitu syfilitického kmene DAL-1 v průběhu experimentální infekce v králíkovi a na základě toho identifikovat genetickou variabilitu v treponemální DNA izolované z lidského klinického materiálu.
Publications
Total number of publications: 6
2019
-
Identification of positively selected genes in human pathogenic treponemes: Syphilis-, yaws-, and bejel-causing strains differ in sets of genes showing adaptive evolution
PLoS neglected tropical diseases, year: 2019, volume: 13, edition: 6, DOI
2017
-
Human Treponema pallidum 11q/j isolate belongs to subsp. endemicum but contains two loci with a sequence in TP0548 and TP0488 similar to subsp. pertenue and subsp. pallidum, respectively
PLoS neglected tropical diseases, year: 2017, volume: 11, edition: 3, DOI
-
Molecular Typing of Syphilis-Causing Strains Among Human Immunodeficiency Virus-Positive Patients in Antwerp, Belgium
Sexually Transmitted Diseases, year: 2017, volume: 44, edition: 6, DOI
2016
-
Characterizing the Syphilis-Causing Treponema pallidum ssp pallidum Proteome Using Complementary Mass Spectrometry
PLoS neglected tropical diseases, year: 2016, volume: 10, edition: 9, DOI
-
Treponema pallidum 11qj Subtype May Correspond to a Treponema pallidum Subsp Endemicum Strain
Sexually transmitted diseases, year: 2016, volume: 43, edition: 8
2015
-
A Retrospective Study on Genetic Heterogeneity within Treponema Strains: Subpopulations Are Genetically Distinct in a Limited Number of Positions
PLoS Neglected Tropical Diseases, year: 2015, volume: 9, edition: 10, DOI