Informace o projektu
Genomová variabilita treponem během experimentální infekce
- Kód projektu
- GP14-29596P
- Období řešení
- 1/2014 - 12/2016
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Postdoktorské projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Lékařská fakulta
- Mgr. Michal Strouhal, Ph.D.
Rod Treponema zahrnuje bakteriální druhy a poddruhy, které jsou obligátními patogeny lidí a zvířat a pro které je charakteristická různá míra patogenity a hostitelské specifity a obecná nemožnost jejich kultivace za podmínek in vitro. Pro tyto bakterie je charakteristická také schopnost uniknout imunitnímu systému příslušného hostitele a tato schopnost je dávána do souvislosti s genomovou variabilitou příslušného treponemálního kmene. Detekce variabilních míst na úrovni příslušného treponemálního kmene tak může vést k většímu porozumění mechanizmů patogeneze treponemálních onemocnění. V této práci navrhujeme identifikovat variabilní úseky v genomech vybraných treponemálních kmenů na základě in silico analýzy dostupných sekvenačních dat, dále charakterizovat vnitrokmenovou variabilitu syfilitického kmene DAL-1 v průběhu experimentální infekce v králíkovi a na základě toho identifikovat genetickou variabilitu v treponemální DNA izolované z lidského klinického materiálu.
Publikace
Počet publikací: 6
2019
-
Identification of positively selected genes in human pathogenic treponemes: Syphilis-, yaws-, and bejel-causing strains differ in sets of genes showing adaptive evolution
PLoS neglected tropical diseases, rok: 2019, ročník: 13, vydání: 6, DOI
2017
-
Human Treponema pallidum 11q/j isolate belongs to subsp. endemicum but contains two loci with a sequence in TP0548 and TP0488 similar to subsp. pertenue and subsp. pallidum, respectively
PLoS neglected tropical diseases, rok: 2017, ročník: 11, vydání: 3, DOI
-
Molecular Typing of Syphilis-Causing Strains Among Human Immunodeficiency Virus-Positive Patients in Antwerp, Belgium
Sexually Transmitted Diseases, rok: 2017, ročník: 44, vydání: 6, DOI
2016
-
Characterizing the Syphilis-Causing Treponema pallidum ssp pallidum Proteome Using Complementary Mass Spectrometry
PLoS neglected tropical diseases, rok: 2016, ročník: 10, vydání: 9, DOI
-
Treponema pallidum 11qj Subtype May Correspond to a Treponema pallidum Subsp Endemicum Strain
Sexually transmitted diseases, rok: 2016, ročník: 43, vydání: 8
2015
-
A Retrospective Study on Genetic Heterogeneity within Treponema Strains: Subpopulations Are Genetically Distinct in a Limited Number of Positions
PLoS Neglected Tropical Diseases, rok: 2015, ročník: 9, vydání: 10, DOI