Project information
Molekulární podstata evolučních přeměn telomer u rostlin řádu Asparagales
- Project Identification
- GA17-09644S
- Project Period
- 1/2017 - 12/2019
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
- Cooperating Organization
-
Institute of Biophysics
- Responsible person Mgr. Eva Sýkorová, CSc.
V r. 2016 jsme identifikovali neobvyklé telomery u rostlin rodu Allium. Společně s našimi předchozími výsledky je nyní jasné, že během evoluce rostlin řádu Asparagales došlo ke dvěma změnám telomer: při první, spojené s divergencí rodu Iris, byly typické rostlinné telomery (TTTAGGG)n nahrazeny telomerami (TTAGGG)n typickými pro obratlovce. Ke druhé změně - z (TTAGGG)n na (CTCGGTTATGGG)n - došlo při divergenci rodu Allium. Cílem projektu je objasnit molekulární podstatu těchto tranzicí: změny v RNA podjednotkách telomeráz a v jejich interakcích s katalytickými podjednotkami, a dále zjistit dopad těchto změn na nukleoproteinové složení a na funkci telomer, která závisí hlavně na telomer-vazebných proteinech. RNA-Seq data budou získána z obohacených frakcí telomerázy a z celkového transkriptomu s cílem identifikovat RNA podjednotky telomeráz, resp. kandidátní telomer-vazebné proteiny. Interakce proteinů se současnými a ancestrálními telomerovými DNA budou testovány kvantitativními
přístupy. Projekt zlepší chápání strukturně-funkčních vztahů telomer a role telomer ve speciaci.
Publications
Total number of publications: 4
2020
-
Optimized Detection of Protein-Protein and Protein-DNA Interactions, with Particular Application to Plant Telomeres
The Nucleus - Methods in Molecular Biology, year: 2020, number of pages: 29 s.
2019
-
Comparative Dissection of Three Giant Genomes: Allium cepa, Allium sativum, and Allium ursinum
International Journal of Molecular Sciences, year: 2019, volume: 20, edition: 3, DOI
-
Telomerase RNAs in land plants
Nucleic acids research, year: 2019, volume: 47, edition: 18, DOI
-
Telomeres in Plants and Humans: Not So Different, Not So Similar
Cells, year: 2019, volume: 8, edition: 1, DOI