Informace o projektu
Molekulární podstata evolučních přeměn telomer u rostlin řádu Asparagales
- Kód projektu
- GA17-09644S
- Období řešení
- 1/2017 - 12/2019
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba Mgr. Eva Sýkorová, CSc.
V r. 2016 jsme identifikovali neobvyklé telomery u rostlin rodu Allium. Společně s našimi předchozími výsledky je nyní jasné, že během evoluce rostlin řádu Asparagales došlo ke dvěma změnám telomer: při první, spojené s divergencí rodu Iris, byly typické rostlinné telomery (TTTAGGG)n nahrazeny telomerami (TTAGGG)n typickými pro obratlovce. Ke druhé změně - z (TTAGGG)n na (CTCGGTTATGGG)n - došlo při divergenci rodu Allium. Cílem projektu je objasnit molekulární podstatu těchto tranzicí: změny v RNA podjednotkách telomeráz a v jejich interakcích s katalytickými podjednotkami, a dále zjistit dopad těchto změn na nukleoproteinové složení a na funkci telomer, která závisí hlavně na telomer-vazebných proteinech. RNA-Seq data budou získána z obohacených frakcí telomerázy a z celkového transkriptomu s cílem identifikovat RNA podjednotky telomeráz, resp. kandidátní telomer-vazebné proteiny. Interakce proteinů se současnými a ancestrálními telomerovými DNA budou testovány kvantitativními
přístupy. Projekt zlepší chápání strukturně-funkčních vztahů telomer a role telomer ve speciaci.
Publikace
Počet publikací: 4
2020
-
Optimized Detection of Protein-Protein and Protein-DNA Interactions, with Particular Application to Plant Telomeres
The Nucleus - Methods in Molecular Biology, rok: 2020, počet stran: 29 s.
2019
-
Comparative Dissection of Three Giant Genomes: Allium cepa, Allium sativum, and Allium ursinum
International Journal of Molecular Sciences, rok: 2019, ročník: 20, vydání: 3, DOI
-
Telomerase RNAs in land plants
Nucleic acids research, rok: 2019, ročník: 47, vydání: 18, DOI
-
Telomeres in Plants and Humans: Not So Different, Not So Similar
Cells, rok: 2019, ročník: 8, vydání: 1, DOI