Project information
Strukturní a funkční studie stafylokokového fága phi812

Staphylococcus aureus je lidský patogen způsobující škálu onemocnění od kožních infekcí po život ohrožující pneumonie, záněty mozku a sepse. K léčbě těchto infekcí by mohl být použit fág phi812, který účinně likviduje většinu kmenů zlatého stafylokoka, včetně těch rezistentních k antibiotikům. Cílem projektu je určení struktury a funkce několika proteinů tvořících kapsid tohoto bakteriofága. Tyto proteiny se pravděpodobně účastní procesu uvolnění fágového genomu do hostitelské bakterie, čímž je zahájena infekce. Proteiny budou exprimovány v buňkách E. coli a jejich struktury určeny pomocí metod makromolekulární krystalografie nebo cryo-elektronové mikroskopie. Na základě těchto struktur bude možné lépe popsat proces infekce bakterie fágem. Současně bude pomocí systému CRISPR/Cas9 v buňkách S. aureus studována funkce fágových proteinů v jejich přirozeném prostředí, tj. jako součást virionu. Vzniklé mutantní formy bakteriofága budou využity pro studii významu dlouhých bičíků bakteriofágů a také pro analýzu interakcí fága se stafylokokových biofilmem, což je struktura, kterou tyto bakterie tvoří v místě infekce.