Go to main content | Go to main menu | Go to search

Project information
Driver mutations in cancer genome of Nothobranchius furzeri: from tumor biology to concept of experimental model of spontaneous carcinogenesis

Investor logo
Project Identification
GA19-20873S (kod CEP: GA19-20873S)
Project Period
1/2019 - 12/2021
Investor / Pogramme / Project type
Czech Science Foundation
  • Standard Projects
MU Faculty or unit
Central European Institute of Technology
Cooperating Organization
Institute of Vertebrate Biology of the ASCR, v. v. i.
  • Responsible person RNDr. Radim Blažek, Ph.D.

Africká anuální ryba Nothobranchius furzeri se v posledních letech stala atraktivním modelovým druhem především v oblasti výzkumu různých aspektů stárnutí. Výjimečnost N. furzeri je dána především extrémně krátkým životním cyklem, rekapitulujícím standardní průběh stárnutí obratlovců v kondenzované podobě a spontánní, věkem podmíněnou karcinogenezí. V pilotním experimentu jsme na rybách inbrední linie N. furzeri popsali incidenci neoplasií v játrech a ledvinách. Výstupem experimentu využívajícího přístup celoexomového sekvenování byla také detekce řady mutací v genech funkčně se podílejících na maligní transformaci. Cílem předkládaného projektu je identifikovat driverové mutace v onkogenech a tumor-supresorových genech a následně charakterizovat jejich roli v procesu maligní transformace u jaterní a ledvinové tkáně N. furzeri. Pro detekci a charakterizaci driverových mutací bude použita metoda celogenomového sekvenování a příslušné bioinformatické nástroje. Vybrané mutací budou studovány in vivo CRISPR/Cas9 mutagenezí. N. furzeri bude popsán jako model sporadické kancerogeneze.

Publications

Total number of publications: 4

2023

2021

2020

You are running an old browser version. We recommend updating your browser to its latest version.

More info