Informace o projektu
Klíčové mutace v nádorovém genomu Nothobranchius furzeri: od nádorové biologie k návrhu experimentálního modelu sporadické kancerogeneze
- Kód projektu
- GA19-20873S (kod CEP: GA19-20873S)
- Období řešení
- 1/2019 - 12/2021
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
- Spolupracující organizace
-
Ústav biologie obratlovců AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba RNDr. Radim Blažek, Ph.D.
Africká anuální ryba Nothobranchius furzeri se v posledních letech stala atraktivním modelovým druhem především v oblasti výzkumu různých aspektů stárnutí. Výjimečnost N. furzeri je dána především extrémně krátkým životním cyklem, rekapitulujícím standardní průběh stárnutí obratlovců v kondenzované podobě a spontánní, věkem podmíněnou karcinogenezí. V pilotním experimentu jsme na rybách inbrední linie N. furzeri popsali incidenci neoplasií v játrech a ledvinách. Výstupem experimentu využívajícího přístup celoexomového sekvenování byla také detekce řady mutací v genech funkčně se podílejících na maligní transformaci. Cílem předkládaného projektu je identifikovat driverové mutace v onkogenech a tumor-supresorových genech a následně charakterizovat jejich roli v procesu maligní transformace u jaterní a ledvinové tkáně N. furzeri. Pro detekci a charakterizaci driverových mutací bude použita metoda celogenomového sekvenování a příslušné bioinformatické nástroje. Vybrané mutací budou studovány in vivo CRISPR/Cas9 mutagenezí. N. furzeri bude popsán jako model sporadické kancerogeneze.
Publikace
Počet publikací: 4
2023
-
From fish to cells: Establishment of continuous cell lines from embryos of annual killifish Nothobranchius furzeri and N. kadleci
Aquatic Toxicology, rok: 2023, ročník: 259, vydání: June, DOI
2021
-
Histopathology of laboratory-reared Nothobranchius fishes: Mycobacterial infections versus neoplastic lesions
Journal of Fish Diseases, rok: 2021, ročník: 44, vydání: 8, DOI
-
Swim bladder as a primary site of mycobacterial infection in Nothobranchius 'belly sliders'
Diseases of aquatic organisms, rok: 2021, ročník: 145, vydání: July, DOI
2020
-
Spontaneous adenocarcinoma of the gas gland in Nothobranchius fishes
Diseases of Aquatic Organisms, rok: 2020, ročník: 137, vydání: 3, DOI