Publication details

Simulace hybridní zóny myši domácí pomocí mnohogenomových rekombinantních kmenů

Authors

MARTINCOVÁ Iva ĎUREJE Ľudovít PIÁLEK Jaroslav

Year of publication 2014
Type Appeared in Conference without Proceedings
Citation
Description Dosud známé rekombinantní inbrední kmeny (RIS) myší, které jsou využívány v biomedicínském výzkumu mapování genů nemocí, jsou sestaveny z klasických laboratorních kmenů. Ty jsou pro studia evoluční biologie nevhodné, neboť (i) jejich genom je kombinací více poddruhů myší a (ii) díky efektu zakladatele mají nízkou haplotypovou pestrost. K odstranění těchto nevýhod jsme na pracovišti ve Studenci odvodili nové inbrední kmeny z divokých populací (WDS) Mus m. musculus a M. m. domesticus a z 8 z nich následně začali generovat RIS. Výběr WDS nebyl náhodný: inbrední genomy zastupují vždy 2 kmeny ze dvou lokalit z obou poddruhů, přičemž lokality jsou symetricky vzdáleny 50 a 250 km od hybridní zóny myší. WDS byly recipročně kříženy nejdříve v rámci lokality, poté mezi lokalitami uvnitř poddruhu, a konečně mezi poddruhy. Takto sestavení F1 hybridi budou po 20 generací inbredizování k dosažení genetické uniformity uvnitř kmenů. Výsledkem bude 32 RIS, každý z nich s jedinečnou kombinací 8 genomů na jednotlivých chromozomech. Reciproční F1 generace mezipoddruhových hybridů může simulovat kolonizaci a první kontakt obou poddruhů na hybridní zóně a tím testovat přítomnost a významnost reprodukčních bariér. U samců bylo vyšetřeno 17 fenotypových znaků, které mohou souviset s jejich reprodukční zdatností. Specificky, na základě předcházejících experimentů a publikovaných dat z křížení mezipoddruhových kmenů jsme předpokládali (1) přítomnost frakce zcela sterilních F1 samců a (2) asymetrii ve výskytu hybridní sterility danou rychlejší evolucí chromozomu X u M. m. musculus. Ačkoliv výsledky z 26 RIS křížení žádnou z předchozích hypotéz nepotvrzují, zjištěná variabilita v reprodukčních parametrech samců (např. 0,35-29,25 mil. spermií) naznačuje, že takto odvozované RIS budou mocným nástrojem pro evoluční studia.

You are running an old browser version. We recommend updating your browser to its latest version.

More info