prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D.

2022

• MicroPEX Data Analyser 1.0*

  KOVÁŘ David MAZURENKO Stanislav VAŠINA Michal DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk

  Software

  Rok: 2022

• Tools for computational design and high-throughput screening of therapeutic enzymes

  VAŠINA Michal VELECKÝ Jan PLANAS IGLESIAS Joan MARQUES Sérgio Manuel ŠKAŘUPOVÁ Jana DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David MAZURENKO Stanislav PROKOP Zbyněk

  Článek v odborném periodiku

  ADVANCED DRUG DELIVERY REVIEWS, rok: 2022, ročník: 183, vydání: April 2022, DOI

• 熱安定性ＦＧＦ２ポリペプチド及びその使用

  DVOŘÁK Petr KREJČÍ Pavel BÁLEK Lukáš EISELLEOVÁ Lívia KONEČNÁ Žaneta DVOŘÁK Pavel BEDNÁŘ David BREZOVSKÝ Jan ŠEBESTOVÁ Eva CHALOUPKOVÁ Radka ŠTĚPÁNKOVÁ Veronika VAŇÁČEK Pavel PROKOP Zbyněk DAMBORSKÝ Jiří BOSÁKOVÁ Michaela

  Patent

  Vydavatel: Japan Patent Office (JPO), stát vydání: Japonsko, číslo patentu: JP7131772, rok: 2022

2021

• Computational enzyme design for metabolic engineering

  DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David PROKOP Zbyněk MAREK Martin MAZURENKO Stanislav ŠTOURAČ Jan MARQUES Sérgio Manuel FONSECA PINTO Gabriela Filipa PLANAS IGLESIAS Joan MUSIL Miloš HON Jiří VÁVRA Ondřej KHAN Rayyan Tariq FILIPOVIČ Jiří KOZLÍKOVÁ Barbora

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2021, druh: Konferenční abstrakty

• Computational Enzyme Stabilization Can Affect Folding Energy Landscapes and Lead to Catalytically Enhanced Domain-Swapped Dimers

  MARKOVÁ Klára KUNKA Antonín CHMELOVÁ Klaudia HAVLÁSEK Martin BABKOVÁ Petra MARQUES Sérgio Manuel VAŠINA Michal PLANAS IGLESIAS Joan CHALOUPKOVÁ Radka BEDNÁŘ David PROKOP Zbyněk DAMBORSKÝ Jiří MAREK Martin

  Článek v odborném periodiku

  ACS Catalysis, rok: 2021, ročník: 11, vydání: 21, DOI

• Engineering protein dynamics for the understanding of divergent evolution of the Renilla luciferase

  TOUL Martin SMITH Andrea RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO José Gaspar MAREK Martin HERNYCHOVÁ Lenka LIŠKOVÁ Veronika PLUSKAL Daniel EMOND Stephane DÖRR Mark PLANAS IGLESIAS Joan CHALOUPKOVÁ Radka BEDNÁŘ David PROKOP Zbyněk BORNSCHEUER Uwe T. HOLLFELDER Florian DAMBORSKÝ Jiří

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2021, druh: Konferenční abstrakty

• Engineering the protein dynamics of an ancestral luciferase

  SCHENKMAYEROVÁ Andrea RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO José Gaspar TOUL Martin MAREK Martin HERNYCHOVÁ Lenka PLANAS IGLESIAS Joan LIŠKOVÁ Veronika PLUSKAL Daniel VAŠINA Michal EMOND Stephane DÖRR Mark CHALOUPKOVÁ Radka BEDNÁŘ David PROKOP Zbyněk HOLLFELDER Florian BORNSCHEUER Uwe T. DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Nature Communications, rok: 2021, ročník: 12, vydání: 1, DOI

• Exploring mechanism of enzyme catalysis by on-chip transient kinetics coupled with global data analysis and molecular modeling

  HESS David DOČKALOVÁ Veronika KOKKONEN Piia Pauliina BEDNÁŘ David DAMBORSKÝ Jiří DEMELLO Andrew PROKOP Zbyněk STAVRAKIS Stavros

  Článek v odborném periodiku

  Chem, rok: 2021, ročník: 7, vydání: 4, DOI

• Substrate inhibition by the blockage of product release and its control by tunnel engineering

  KOKKONEN Piia Pauliina BEIER Andy MAZURENKO Stanislav DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David PROKOP Zbyněk

  Článek v odborném periodiku

  RSC Chemical Biology, rok: 2021, ročník: 2, vydání: 2, DOI

2020

• A Haloalkane Dehalogenase from Saccharomonospora viridis Strain DSM 43017, a Compost Bacterium with Unusual Catalytic Residues, Unique (S)-Enantiopreference, and High Thermostability

  CHMELOVÁ Klaudia ŠEBESTOVÁ Eva LIŠKOVÁ Veronika BEIER Andy BEDNÁŘ David PROKOP Zbyněk CHALOUPKOVÁ Radka DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Applied and Environmental Microbiology, rok: 2020, ročník: 86, vydání: 17, DOI