Mgr. Adrián Rošinec

2025

• PDBCharges: Quantum-mechanical partial atomic charges for PDB structures

  BUČEKOVÁ Gabriela SCHINDLER Ondřej SVOBODA Tomáš ROŠINEC Adrián RAČEK Tomáš TICHÝ Dominik SVOBODOVÁ Radka

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2025, druh: Konferenční abstrakty

2024

• 3D-af-Surfer: Protein structural embeddings of AlphaFold DB

  NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš ROŠINEC Adrián OĽHA Jaroslav GREŠOVÁ Katarína DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Specializovaná databáze

  Rok: 2024, druh: Specializovaná databáze

• 3DZD: Protein structural embeddings of AlphaFold DB v4

  NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš ROŠINEC Adrián OĽHA Jaroslav GREŠOVÁ Katarína DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Specializovaná databáze

  Rok: 2024, druh: Specializovaná databáze

• 3DZD: Protein structural embeddings of ESM Atlas

  NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš ROŠINEC Adrián OĽHA Jaroslav GREŠOVÁ Katarína DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Projekty výzkumu a vývoje

  Rok: 2024, druh: Projekty výzkumu a vývoje

• AlphaFind

  SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David ČILLÍK Jakub NOVOTNÁ Lucie ROŠINEC Adrián

  Software

  Rok: 2024

• AlphaFind — discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB

  GREŠOVÁ Katarína ŠPRINGEROVÁ Pavlína SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David OĽHA Jaroslav ROŠINEC Adrián JÁNOŠOVÁ Miriama ČILLÍK Jakub PORUBSKÁ Jana SVOBODOVÁ Radka DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2024, druh: Konferenční abstrakty

• AlphaFind — discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB

  SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David OĽHA Jaroslav ROŠINEC Adrián GREŠOVÁ Katarína ČILLÍK Jakub JÁNOŠOVÁ Miriama PORUBSKÁ Jana SVOBODOVÁ Radka DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2024, druh: Konferenční abstrakty

• AlphaFind: Discover structure similarity across the entire known proteome

  PROCHÁZKA David SLANINÁKOVÁ Terézia OĽHA Jaroslav ROŠINEC Adrián GREŠOVÁ Katarína JÁNOŠOVÁ Miriama ČILLÍK Jakub PORUBSKÁ Jana SVOBODOVÁ Radka DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Výzkumná zpráva

  Rok: 2024

• AlphaFind: Discover structure similarity across the entire known proteome – data and model

  NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš GREŠOVÁ Katarína OĽHA Jaroslav DOHNAL Vlastislav ROŠINEC Adrián ANTOL Matej

  Specializovaná databáze

  Rok: 2024, druh: Specializovaná databáze

• AlphaFind: discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB

  PROCHÁZKA David SLANINÁKOVÁ Terézia OĽHA Jaroslav ROŠINEC Adrián GREŠOVÁ Katarína JÁNOŠOVÁ Miriama ČILLÍK Jakub PORUBSKÁ Jana SVOBODOVÁ Radka DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic acids research, rok: 2024, ročník: 52, vydání: W1, DOI