Informace o projektu
Vliv metylace a acetylace na strukturu chromatinu
- Kód projektu
- GP202/03/D033
- Období řešení
- 9/2003 - 8/2006
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Postdoktorské projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Fakulta informatiky
- Ing. Magdalena Skalníková, CSc.
- Klíčová slova
- Metylace DNA, Acetylace Histonů, Struktura chromatinu, FISH
Biochemické modifikace DNA a histonů (zejména metylace a acetylace) patří mezi epigenetické regulační mechanismy, které ovlivňují strukturu chromatinu vzhledem k jeho transkripční aktivitě/inaktivitě. Zmíněné modifikace histonů a DNA fungují často paralelně, ovšem vzájemné vztahy mezi jednotlivými mechanismy epigenetické dědičnosti, např. vztah mezi acetylací histonů versus metylace DNA, nejsou dosud objasněny. V našich experimentech bude studován metylační stav DNA, histonů a acetylační stav histonů na metafázních chromosomech lidských krevních buněk. Dále bude studován vliv hypometylačního a hyperacetylačního činidla na míru metylace/acetylace histonů a DNA. Vliv těchto biochemických modifikací bude rovněž hodnocen s ohledem na strukturu chromatinu vyššího řádu krevních buněk. Fluorescenční in situ hybridizace a imunofluorescenční metody v kombinaci s cytometrií s vysokým rozlišením umožní vizualizaci vybraných metafázních chromosomů vzhledem k jejich obsahu CpG ostrůvků.
Výsledky
V navrhovaném projektu bude hodnocen metylační stav DNA a histonu H3, dále pak acetylační stav histonu H3 u buněk lidské leukemické linie HL-60 nebo u jiných krevních buněk ovlivňovaných hypometylačním nebo hyperacetylačním činidlem.
Publikace
Počet publikací: 5
2007
-
Distinct patterns of histone methylation and acetylation in human interphase nuclei
Physiological Research, rok: 2007, ročník: 56, vydání: 6
2006
-
Automatic Detection of Histones on Chromosome X in Images of Cell Nuclei
Clinician and Technology (Lékař a technika), rok: 2006, ročník: roč. 36, vydání: 2
2005
-
Nuclear levels and patterns of histone H3 modification and HP1 proteins after inhibition of histone deacetylases
Journal of Cell Science, rok: 2005, ročník: 118, vydání: 21
2004
-
Cytological study of DNA methylation and histone methylation patterns in human cell lines
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Relationship of HP1 proteins to centromeric heterochromatin characterized by the presence of H3(K9) and absence of H3(K4) dimethylation
Biophysics of the Genome, rok: 2004