Přejít k obsahu | Přejít k hlavnímu menu | Přejít k vyhledávání

Informace o projektu
Podjednotky urcující DNA specificitu bakteriální RNA polymerázy s flexibilními doménami: funkce a dynamika

Logo poskytovatele
Kód projektu
GA13-16842S
Období řešení
2/2013 - 12/2017
Investor / Programový rámec / typ projektu
Grantová agentura ČR
  • Standardní projekty
Fakulta / Pracoviště MU
Středoevropský technologický institut
Spolupracující organizace
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
  • Odpovědná osoba Mgr. Libor Krásný, PhD.

V G+ bakteriích jsou delta a sigma podjednotky RNA polymerázy (RNAP) zásadními determinanty její specifity pro promotorovou DNA. Podjednotky delta i vegetativní sigmaA (SigA) obsahují domény, které se pohybují vuci zbytku molekuly. V soucasnosti jsme vyrešili 3D strukturu delty z Bacillus subtilis a identifikovali dve domény v tomto proteinu. Popsali jsme vliv delty na transkripci z vybraných promotoru a identifikovali jsme približnou polohu delty na RNAP, kde se váže v blízkosti SigA. Navrhujeme urcit vliv delty na celogenomové úrovni, urcit funkci jednotlivých domén delty a vytvorit strukturní model delty a SigA v komplexu s RNAP, který popíše i dynamiku jejich flexibilních cástí a charakterizuje jejich vzájemné interakce. Tyto experimenty nám umožní vytvorit komplexní model bunecné role proteinu delta. Výsledky projektu významne posunou naše porozumení transkripcní mašinerii z G+ bakterií, které zahrnují radu medicinálne a prumyslove významných druhu.

Publikace

Počet publikací: 6

2017

2014

2013

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info