2024

• A sodium/potassium switch for G4-prone G/C-rich sequences

  LUO Yu LENARČIČ ŽIVKOVIC Martina WANG Jiawei RYNEŠ Jan TRANTÍRKOVÁ Silvie TRANTÍREK Lukáš VERGA Daniela MERGNY Jean-Louis

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic acids research, rok: 2024, ročník: 52, vydání: 1, DOI

• In-cell NMR suggests that DNA i-motif levels are strongly depleted in living human cells

  VÍŠKOVÁ Pavlína IŠTVÁNKOVÁ Eva RYNEŠ Jan DŽATKO Šimon LOJA Tomáš LENARČIČ ŽIVKOVIC Martina RIGO Riccardo EL-KHOURY Roberto SERRANO-CHACON Israel DAMHA Masad J GONZALEZ Carlos MERGNY Jean-Louis TRANTÍRKOVÁ Silvie TRANTÍREK Lukáš

  Článek v odborném periodiku

  Nature Communications, rok: 2024, ročník: 15, vydání: 1, DOI

2023

• DNA i-motif formation at neutral pH is driven by kinetic partitioning

  ŠKOLÁKOVÁ Petra GAJARSKÝ Martin PALACKÝ Jan ŠUBERT Denis RENČIUK Daniel TRANTÍREK Lukáš MERGNY Jean-Louis VORLICKOVA Michaela

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2023, ročník: 51, vydání: 6, DOI

2021

• In-Cell NMR Spectroscopy of Functional Riboswitch Aptamers in Eukaryotic Cells

  BROFT P. DŽATKO Šimon KRAFČÍKOVÁ Michaela WACKER A. HANSEL-HERTSCH Robert DOTSCH Volker TRANTÍREK Lukáš SCHWALBE Harald

  Článek v odborném periodiku

  Angewandte Chemie International Edition, rok: 2021, ročník: 60, vydání: 2, DOI

• Insight into formation propensity of pseudocircular DNA G-hairpins

  LENARČIČ ŽIVKOVIĆ Martina GAJARSKÝ Martin BEKOVÁ Kateřina STADLBAUER P. VICHEREK Lukáš PETROVA M. FIALA Radovan ROSENBERG I. ŠPONER Jiří PLAVEC J. TRANTÍREK Lukáš

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic acids research, rok: 2021, ročník: 49, vydání: 4, DOI

• Thermal and pH stabilities of i‐DNA: confronting in vitro experiments with models and in‐cell NMR data

  CHENG Mingpan QIU Dehui TAMON Liezel IŠTVÁNKOVÁ Eva VÍŠKOVÁ Pavlína AMRANE Samir GUÉDIN Aurore CHEN Jielin LACROIX Laurent JU Huangxian TRANTÍREK Lukáš SAHAKYAN Aleksandr B. ZHOU Jun MERGNY Jean-Louis

  Článek v odborném periodiku

  ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, rok: 2021, ročník: 60, vydání: 18, DOI

2019

• Dishevelled-3 conformation dynamics analyzed by FRET-based biosensors reveals a key role of casein kinase 1

  HARNOŠ Jakub CANIZAL M.C.A. JURÁSEK Miroslav KUMAR Jitender HOLLER Cornelia SCHAMBONY Alexandra HANÁKOVÁ Kateřina BERNATÍK Ondřej ZDRÁHAL Zbyněk GÖMÖRYOVÁ Kristína GYBEĽ Tomáš RADASZKIEWICZ Tomasz Witold KRAVEC Marek TRANTÍREK Lukáš RYNEŠ Jan DAVE Zankruti FERNANDEZ-LLAMAZARES Ana Iris VÁCHA Robert TRIPSIANES Konstantinos HOFFMANN Carsten BRYJA Vítězslav

  Článek v odborném periodiku

  Nature Communications, rok: 2019, ročník: 10, vydání: APR 18 2019, DOI

• Monitoring DNA-Ligand Interactions in Living Human Cells Using NMR Spectroscopy

  KRAFČÍKOVÁ Michaela DŽATKO Šimon CARON C. GRANZHAN A. FIALA Radovan LOJA Tomáš TEULADE-FICHOU M.P. FESSL T. HANSEL-HERTSCH R. MERGNY J.L. FOLDYNOVA-TRANTIRKOVA S. TRANTÍREK Lukáš

  Článek v odborném periodiku

  Journal of the American Chemical Society, rok: 2019, ročník: 141, vydání: 34, DOI