Informace o projektu
Chromatinové prostředí indukované genotoxickými látkami
- Kód projektu
- GJ19-11880Y (kod CEP: GJ19-11880Y)
- Období řešení
- 1/2019 - 12/2022
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Juniorské granty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
Poškození DNA indukuje reorganizaci chromatinu nezbytnou k navedení poškozených do těsné blízkosti opravných proteinových komplexů, nutných pro efektivní opravu poškozené DNA. V rostlinách není zcela známo, jakými změnami na úrovni pozice nukleosomů, výměny histonových variant nebo skladby histonových modifikací, okolí poškozené DNA během opravy prochází. V tomto projektu budeme detailně studovat změny chromatinu způsobené inhibitorem topoizomerázy I camptothecinem (CPT) a určíme, jak se mění umístění a složení nukleosomů, které oblasti genomu jsou CPT přednostně ovlivněny a zda určitá specifická dráha zprostředkovává odpověď na poškození DNA touto látku. V projektu budeme využívat rosrtlinných linií mutantních defektních v genech pro správné sestavování chromatinu, které vykazují odolnost vůči CPT a tak poslouží jako unikátní experimentální systém. Vzhledem k tomu, že CPT se používá k léčbě rakoviny a výsledek tohoto projektu přinese hlubší znalosti o buněčné odpovědi na stimulaci CPT, výsledky mohou být potenciálně využity také v klinickém výzkumu.
Publikace
Počet publikací: 6
2022
-
Laser microirradiation as a versatile system for probing protein recruitment and protein-protein interactions at DNA lesions in plants
New Phytologist, rok: 2022, ročník: 234, vydání: 5, DOI
2021
-
Disruption of NAP1 genes in Arabidopsis thaliana suppresses the fas1 mutant phenotype, enhances genome stability and changes chromatin compaction
The Plant Journal, rok: 2021, ročník: 106, vydání: 1, DOI
-
G2/M-checkpoint activation in fasciata1 rescues an aberrant S-phase checkpoint but causes genome instability
Plant Physiology, rok: 2021, ročník: 186, vydání: 4, DOI
-
Nucleolar rDNA folds into condensed foci with a specific combination of epigenetic marks
Plant Journal, rok: 2021, ročník: 105, vydání: 6, DOI
-
Super-resolution microscopy of chromatin fibers and quantitative DNA methylation analysis of DNA fiber preparations
Journal of Cell Science, rok: 2021, ročník: 134, vydání: 15, DOI
2020
-
Large tandem duplications affect gene expression, 3D organization, and plant-pathogen response
Genome research, rok: 2020, ročník: 30, vydání: 11, DOI