Informace o projektu
Single cell analysis: a modern tool to study clonal evolution in high-risk patients with chronic lymphocytic leukemia
(Single cell analysis of CLL cells)
- Kód projektu
- NU20-08-00314
- Období řešení
- 5/2020 - 12/2023
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo zdravotnictví ČR
- Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2020 - 2026
- Podprogram 1 - standardní
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
- Spolupracující organizace
-
Fakultní nemocnice Brno
- Odpovědná osoba Mgr. Jana Kotašková, Ph.D.
The proposed project builds on continuous well established research of our team in the field of hematologic malignancies. In this study we would like to profound our knowledge and understanding the mechanisms underlying clonal evolution of chronic lymphocytic leukaemia (CLL) cells. We have already studied CLL using variety of bulk analysis moreover we have also succeeded in single cell analysis. We believe that true personalised medicine is based of detailed characterisation of malignant cells of each patient with the potential to detect the most aggressive clones. From this prospective, single cell analysis gives the best opportunity to fulfil this need. The aim of our study is to compare transcriptomes of thousands CLL cells from consecutively collected samples of patients with aggressive disease with the aim to define the properties of subclones responsible for disease refractoriness.
Cíle udržitelného rozvoje
Masarykova univerzita se hlásí k cílům udržitelného rozvoje OSN, jejichž záměrem je do roku 2030 zlepšit podmínky a kvalitu života na naší planetě.
Publikace
Počet publikací: 20
2024
-
Integrative NGS testing reveals clonal dynamics of adverse genomic defects contributing to a natural progression in treatment-naïve CLL patients
British journal of haematology, rok: 2024, ročník: 204, vydání: 1, DOI
-
IκBε deficiency accelerates disease development in chronic lymphocytic leukemia
Leukemia, rok: 2024, ročník: 38, vydání: 6, DOI
-
Unveiling the dynamics and molecular landscape of a rare chronic lymphocytic leukemia subpopulation driving refractoriness: insights from single-cell RNA sequencing
Molecular oncology, rok: 2024, ročník: 18, vydání: 10, DOI
2023
-
A web-based bioinformatic tool LYNX for targeted LYmphoid NeXt- generation sequencing data analysis and visualization for hematooncology.
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
Cerebral organoids derived from patients with Alzheimer´s disease with PSEN1/2 mutations have defective tissue patterning and altered development
CELL REPORTS, rok: 2023, ročník: 42, vydání: 11, DOI
-
RNA sekvenovanie jednotlivých buniek umožňuje charakterizáciu a sledovanie zriedkavých CLL buniek s potenciálom navodiť refraktérne ochorenie.
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
Single-cell RNA-sequencing enables tracking and characterization of rare CLL cells with the potential to cause refractoriness.
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
Tracking CLL cells with aberrations in the TP53 gene using scRNA-seq in relapsed/refractory patients.
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
2022
-
Cytogenetics in Chronic Lymphocytic Leukemia: ERIC Perspectives and Recommendations
HemaSphere, rok: 2022, ročník: 6, vydání: 4, DOI
-
Exploring different aspects of clonal evolution in chronic lymphocytic leukemia.
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty