Navrhovaný projekt je zaměřen na studium změn dynamiky proteinů v důsledku vazby feromonů. Myší MUP-I, zkoumaný spolunavrhovatelem, byl vybrán jako modelový protein. Dynamické parametry popisující pohyby amidových vazeb budou stanoveny z relaxačních dat pro volný protein a protein s navázaným feromonem a jeho analogy. Po zavedení pokročilých technik izotopového značení (značení 13C s částečnou deuterací) budou dynamická měření rozšířena na C-H vazby postranních řetězců. Vliv vazby ligandů na konformační entropii bude stanoven z hodnot parametru uspořádání (order parameter) a srovnán s kalorimetrickými daty. Výpočetní metody budou využity k určení ostatních změn volné energie v důsledku vazby ligandů. Struktury volného MUP-I a komplexu MUP-I s navázaným feromonem budou určeny pomocí NMR v roztoku a srovnány s krystalovými strukturami získanými v laboratoři spolunavrhovatele.

Publikace