Informace o publikaci
Multiplexní nástroj pro rychlou detekci patogenních virů spojených s kontaminovanou vodou a prostředím
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2021 |
| Druh | Konferenční abstrakty |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Popis | Virová agens se v poslední době dostávají do popředí zájmu, a to i ve spojitosti s možnou kontaminací vodních zdrojů a prostředí. Nejčastějšími následky onemocnění, která se s těmito kontaminacemi pojí, jsou gastroenteritidy projevující se horečkou, zvracením a vodnatými průjmy. Kromě mírných horečnatých onemocnění však mohou viry způsobovat i závažnější stavy – infekce dýchacího ústrojí, hepatitidy, konjunktivitidy, aseptické meningitidy, myokarditidy, encefalitidy či paralýzy. V současnosti rutinně používané metody pro detekci těchto agens mají své limity. Jedním z nejpodstatnějších je omezená možnost vytvářet multiplexní systémy pro detekci většího množství patogenů současně. Z tohoto důvodu jsme vyvinuli nový detekční nástroj, který nám toto omezení umožní překonat. Zkombinovali jsme metodu multiplexní ligační reakce a PCR s komerčně dostupnou technologií xMAP (Luminex corporation, Texas, USA). Kombinace těchto metod nám umožňuje vytvářet otevřené detekční systémy až pro 50 různých cílů. Pro detekci virů spojených s alimentárními nákazami byl vyvinut a optimalizován panel zahrnující ty nejvíce diskutované původce - noroviry, viry hepatitidy A a E, adenoviry a rotaviry. Spolehlivost tohoto panelu byla ověřena i mezilaboratorními testy, kdy byl potvrzen limit detekce této metody, 5 × 100 až 5 × 101 genomových ekvivalentů v reakci. Tento systém tak představuje rychlou, robustní, spolehlivou a dostatečně citlivou metodu pro možné monitorování a kontrolu mikrobiologické bezpečnosti potravin, vodních zdrojů a prostředí, kromě toho může sloužit i jako pomocný nástroj při epidemiologických šetřeních. V souvislosti s aktuální epidemiologickou situací byl tento detekční panel doplněn o systémy cílené na viry způsobující respirační onemocnění (tzn. původce nového onemocnění COVID-19 a chřipek A a B). |