Informace o publikaci
Příprava vzorku pro analýzu proteomu leukemických buněk BM2 dvourozměrnou elektroforézou
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2004 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | 1. česká proteomická konference |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Onkologie a hematologie |
| Klíčová slova | Two-dimensional electrophoresis; proteome analysis; sample preparation |
| Popis | Výsledek dvourozměrné elektroforézy (2D) proteinů výnamně závisí na způsobu přípravy vzorku. Cílem této práce bylo stanovit optimální podmínky pro přípravu vzorku kuřecích monoblastů transormovaných onkogenem v-myb. Modifikací lyzačního (9 M urea, 2 % NP-40, 3 % CHAPS, 70 mM DTT, 2 % ampholyte pH 8-10.5) a rehydratačního pufru (8 M urea, 4 % CHAPS, 100 mM DTT, 0.001 % bromphenol blue, 0.2 % ampholyte pH 3-10)přidáním thiomočoviny jsme zřetelně zvýšili počet proteinů rozlišitelných v 2D gelu. Sonikací vzorku jsme dále zvýšili počet a densitu proteinů na elektroforetogramu. Přítomnost thiomočoviny v lyzačním/rehydratačním pufru a sonikace zvýšila počet rozlišitelných proteinových skvrn přibližně osmkrát. Tyto experimentální podmínky použijeme při analýze proteomu během diferenciace monoblastů BM2. |
| Související projekty: |