The study on the FnrP, NNR and NarR transcription regulator function in bacterium Paracoccus denitrificans at global proteome level

• Název česky: Studium funkce transkripčních regulátorů FnrP, NNR a NarR u bakterie Paracoccus denitrificans na globální proteomové úrovni
• Autoři: BOUCHAL Pavel; VYHLÍDALOVÁ Tereza; STRUHÁROVÁ Iva; ŠEDO Ondrej; ZDRÁHAL Zbyněk; REIJNDERS Willem; VAN SPANNING Rob; KUČERA Igor
• Rok publikování: 2008
• Druh: Konferenční abstrakty
• Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta
• Popis: Paracoccus denitrificans patří mezi fakultativně autotrofní půdní bakterie často studované na poli bioenergetiky. V prezentované práci jsme se zaměřili na studium funkce tří známých transkripčních regulátorů FnrP, NNR and NarR, které mimo jiné pracují jako senzory pro kyslík, substráty a intermediáty denitrifikační dráhy v procesech adaptace P. denitrificans na změny vnějších podmínek. Proteinové složení čtyř kmenů P. denitrificans (divoký kmen a dále mutantní kmeny FnrP-, NNR- and NarR-) rostlých za třech růstových podmínek jsme analyzovali pomocí proteomických technik. Bylo detekováno a identifikováno přes 500 proteinů. Zatímco známé změny indukce klíčových denitrifikačních enzymů byly potvrzeny, nové proteiny modulované koncentrací kyslíku a s vlivem regulačních proteinů na jejich expresi byly detekovány. Soubor těchto genů je prezentován a souvislosti mezi růstovými podmínkami, úlohou regulačních proteinů a genovou expresí jsou diskutovány.

Související projekty

• Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
• Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
• Studium molekulárních mechanismů adaptace bakterií na změny prostředí pomocí proteomických technik