Informace o publikaci

Combination of mRNA and protein microarray analysis in complex cell profiling

Název česky	Kombinace mRNA a proteinové microarray analýzy v komplexním profilování buněk
Autoři	ŠIMARA Pavel KOUTNÁ Irena STEJSKAL Stanislav KRONTORÁD Petr RUČKA Zdeněk PETERKOVÁ Martina KOZUBEK Michal
Rok publikování	2009
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	Neoplasma
Fakulta / Pracoviště MU	Fakulta informatiky
Citace
www	Odborný vědecký článek
Obor	Genetika a molekulární biologie
Klíčová slova	microarray; cell profiling; protein expression; mRNA expression; HL-60
Popis	Tato studie kombinuje mRNA a proteinovou analýzu za využití cDNA microarrays a protilátkových microarrays. Integrací těchto dvou technologií získáváme komplexní pohled na buněčný molekulární profil. Studie byla provedena na leukemické buněčné linii HL-60, která diferencovala do granulocytárního stádia po přidání kyseliny retinové (ATRA). Tato buněčná linie tedy slouží jako in-vitro model hematopoezy. Pozorovali jsme změnu hladiny určitých proteinů, účastnících se zejména diferenciačních a apoptických signálních drah, často s onkogenetickým potenciálem. Hladina mRNA vždy neodpovídala hladině exprimovaného proteinu.
Související projekty:	Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů Funkční a molekulární charakteristiky nádorových a normálních kmenových buněk - identifikace cílů pro nová terapeutika a terapeutické strategie