Biomarkers of lymph node metastasis in low-grade breast cancer: An integrated, proteomics-based approach

• Název česky: Vyhledávání biomarkerů metastazování u low-grade karcinomů prsu: Integrovaný přístup na bázi proteomiky
• Autoři: BOUCHAL Pavel; MUDROCHOVÁ Monika; BUDINSKÁ Eva; BORTLÍČEK Zbyněk; STRUHÁROVÁ Iva; HERNYCHOVÁ Lenka; ROUMELIOTIS Theodoros; GARBIS Spiros D.; HRSTKA Roman; MÜLLER Petr; NENUTIL Rudolf; VOJTĚŠEK Bořivoj
• Rok publikování: 2010
• Druh: Vyžádané přednášky
• Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta
• Popis: Naše práce je zaměřena na vyhledávání biomarkerů metastazování v souboru 96 primárních nádorů prsu rozdělených podle grade a přítomnosti uzlinových metastáz. K tomuto účelu byly použity následující proteomické přístupy: (i) SELDI-TOF MS nám umožnilo kvantifikovat 130 píků intaktních proteinů, přičemž byl detegován a identifikován jeden pík korelující se stavem uzlinových metastáz. (ii) Vybarný soubor primárních nádorů byl analyzován pomocí metodiky iTRAQ-2DLC-MS/MS. Tento přístup umožňuje současnou identifikaci a vantifikaci více než 600 proteinů. Diferenciálně experimované proteiny náleží do několika funkčních skupin, které byly podrobně popsány v prezentaci. (iii) Vybraný soubor nádrových lyzátů byl analyzován také pomocí 2-D PAGE. Navíc, expresní profily 26 genových produktů byly evaluovány pomocí qRT-PCR. V souhrnu naše výsledky naznačují rozdílnou expresi cytoskeletálních proteinů, proteinů rodiny anterior-gradient a proteinů zapojených do biosystézy hemu.

Související projekty

• Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
• Studium molekulárních mechanismů časného metastazování do lymfatických uzlin u karcinomu prsu nízkého stupně malignity pomocí proteomických technik