Application of reverse transcription PCR and capillary electrophoresis in the analysis of T-cell receptor beta variable repertoire

• Název česky: Aplikace RT-PCR a kapilární elektroforézy při analýze TCR beta variabilního repertoáru
• Autoři: TESAŘOVÁ Lenka; PETERKOVÁ Martina; STEJSKAL Stanislav; POTĚŠILOVÁ Michaela; KRONTORÁD KOUTNÁ Irena
• Rok publikování: 2010
• Druh: Článek ve sborníku
• Konference: Advances in Molecular and Cancer Biology, 2010
• Fakulta / Pracoviště MU: Fakulta informatiky
• Obor: Genetika a molekulární biologie
• Klíčová slova: Reverse transcription polymerase chain reaction; Capillary electrophoresis; T-cell receptor; Beta variable families
• Popis: Prokázalo se, že sledovat diverzitu populace T lymfocytů je výhodné v mnoha klinických podmínkách, kdy se hodnotí stav imunitního systému jedince. Nejčastěji se analyzují BV rodiny. Cílem studie bylo zavést metodiku pro specifické stanovení relativní exprese BV rodin a vyhodnotit její použitelnost v podmínkách mnohočetného myelomu. Pomocí RT-PCR se analyzovali vzorky periferní krve od zdravých dárců a pacientů s mnohočetným myelomem. Množství PCR produktů bylo stanoveno pomocí přístroje Agilent 2100 Bioanalyzer a převedeno na relativní expresi BV rodin. Tato práce poskytuje RT-PCR s primery, které umožňují analýzu celého repertoáru BV rodin. Dále popisuje využití kapilární elektroforézy při vyhodnocení relativní exprese BV rodin po jejich amplifikaci. Metodika je rychlá a jednoduchá, tudíž vhodná na první skrínink složení populace T lymfocytů. Dokázali jsme její schopnost detekovat změny v repertoáru BV rodin u pacientů s mnohočetným myelomem v porovnání s poměrně stabilním profilem u zdravých dárců.

Související projekty

• Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů
• Funkční a molekulární charakteristiky nádorových a normálních kmenových buněk - identifikace cílů pro nová terapeutika a terapeutické strategie