Informace o publikaci
Efficiency of PCR-based methods in discriminating Bifidobacterium longum ssp. longum and Bifidobacterium longum ssp. infantis strains of human origin
| Název česky | Účinnost metod založených na PCR při rozlišení kmenů Bifidobacterium longum ssp. longum a Bifidobacterium longum ssp. infantis lidského původu |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2011 |
| Druh | Článek v odborném periodiku |
| Časopis / Zdroj | Journal of Microbiological Methods |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Doi | http://dx.doi.org/10.1016/j.mimet.2011.06.014 |
| Obor | Genetika a molekulární biologie |
| Klíčová slova | Bifidobacterium longum; PCR; ARDR; RAPD; rep-PCR |
| Popis | K rozlišení B. longum ssp. longum and B. longum ssp. infantis byly použity 4 molekulárně-biologické metody (polymerázová řetězová reakce (PCR), metoda náhodně amplifikované polymorfní DNA (RAPD) s 5 primery, interrepetitivní polymerázová řetězová reakce (rep-PCR) s primery pro BOXA1R elementy a (GTG)5, restrikční analýza amplifikované ribosomální DNA (ARDRA) a biochemické metody. Bylo analyzováno 28 kmenů izolovaných z 25 zdravých a plně kojených dětí a 3 dospělých jedinců a 2 sbírkové kmeny. Uvedené metody společně s fermentací arabionosy/ melezitosy rozlišily B. longum ssp. longum a B. longum ssp. infantis do podruhů pouze sbírkové kmeny. Na druhé straně ARDRA zařadila do podruhů B. longum/infantis analyzované kmeny při použití jedinné restrikční endonukleasy Sau3AI. Dále byly zařazeny do podruhů sbírkové kmeny B. longum CCM 3764 jako B. longum ssp. longum CCM 3764, B. longum ATCC 17930 jako B. longum ssp. infantis ATCC 17930. |
| Související projekty: |