RNDr. David Sehnal, Ph.D.

2021

• NAChRDB: Solving the puzzle of structure-function relationships to clarify the allostery of nicotinic acetylcholine receptors (nAChRs)

  CHARESHNEU Aliaksei PANT Purbaj RAMOS Ravi José Tristao SEHNAL David GÖKBEL Tugrul IONESCU Crina-Maria KOČA Jaroslav

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2021, druh: Konferenční abstrakty

• NAChRDB: Solving the puzzle of structure-function relationships to clarify the allostery of nicotinic acetylcholine receptors (nAChRs)

  CHARESHNEU Aliaksei PANT Purbaj RAMOS Ravi José Tristao SEHNAL David GÖKBEL Tugrul IONESCU Crina-Maria KOČA Jaroslav

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2021, druh: Další prezentace na konferencích

2020

• BinaryCIF and CIFTools-Lightweight, efficient and extensible macromolecular data management

  SEHNAL David BITTRICH Sebastian VELANKAR Sameer KOČA Jaroslav SVOBODOVÁ Radka BURLEY Stephen K. ROSE Alexander S.

  Článek v odborném periodiku

  PLoS Computational Biology, rok: 2020, ročník: 16, vydání: 10, DOI

• High-performance macromolecular data delivery and visualization for the web

  SEHNAL David SVOBODOVÁ Radka BERKA Karel ROSE Alexander S. BURLEY Stephen K. VELANKAR Sameer KOČA Jaroslav

  Článek v odborném periodiku

  Acta Crystallographica Section D: Structural Biology, rok: 2020, ročník: 76, vydání: December 2020, DOI

• PDBe: improved findability of macromolecular structure data in the PDB

  ARMSTRONG David R. BERRISFORD John M. CONROY Matthew J. GUTMANAS Aleksandras ANYANGO Stephen CHOUDHARY Preeti CLARK Alice R. DANA Jose M. DESHPANDE Mandar DUNLOP Roisin GANE Paul GÁBOROVÁ Romana GUPTA Deepti HASLAM Pauline KOČA Jaroslav MAK Lora MIR Saqib MUKHOPADHYAY Abhik NADZIRIN Nurul NAIR Sreenath PAYSAN-LAFOSSE Typhaine PRAVDA Lukas SEHNAL David SALIH Osman SMART Oliver TOLCHARD James VARADI Mihaly SVOBODOVÁ Radka ZAKI Hossam KLEYWEGT Gerard J. VELANKAR Sameer

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic acids research, rok: 2020, ročník: 48, vydání: D1, DOI

• Visualization and Analysis of Protein Structures with LiteMol Suite

  SEHNAL David SVOBODOVÁ Radka BERKA K. PRAVDA Lukáš MIDLIK Adam KOČA Jaroslav

  Kapitola v knize

  STRUCTURAL BIOINFORMATICS: METHODS AND PROTOCOLS, rok: 2020, počet stran: 13 s.

2019

• Protein Data Bank: the single global archive for 3D macromolecular structure data

  BURLEY S.K. BERMAN H.M. BHIKADIYA C. BI C.X. CHEN L. DI COSTANZO L. CHRISTIE C. DUARTE J.M. DUTTA S. FENG Z.K. GHOSH S. GOODSELL D.S. GREEN R.K. GURANOVIC V. GUZENKO D. HUDSON B.P. LIANG Y.H. LOWE R. PEISACH E. PERISKOVA I. RANDLE C. ROSE A. SEKHARAN M. SHAO CH. TAO Y.P. VALASATAVA Y. VOIGT M. WESTBROOK J. YOUNG J. ZARDECKI C. ZHURAVLEVA M. KURISU G. NAKAMURA H. KENGAKU Y. CHO H. SATO J. KIM J.Y. IKEGAWA Y. NAKAGAWA A. YAMASHITA R. KUDOU T. BEKKER G.J. SUZUKI H. IWATA T. YOKOCHI M. KOBAYASHI N. FUJIWARA T. VELANKAR S. KLEYWEGT G.J. ANYANGO S. ARMSTRONG D.R. BERRISFORD J.M. CONROY M.J. DANA J.M. DESHPANDE M. GANE P. GÁBOROVÁ Romana GUPTA D. GUTMANAS A. KOČA Jaroslav MAK L. MIR S. MUKHOPADHYAY A. NADZIRIN N. NAIR S. PATWARDHAN A. PAYSAN-LAFOSSE T. PRAVDA Lukáš SALIH O. SEHNAL David VARADI M. SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka MARKLEY J.L. HOCH J.C. ROMERO P.R. BASKARAN K. MAZIUK D. ULRICH E.L. WEDELL J.R. YAO H.Y. LIVNY M. IOANNIDIS Y.E.

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2019, ročník: 47, vydání: D1, DOI

• Rapidly Display Glycan Symbols in 3D Structures: 3D-SNFG in LiteMol

  SEHNAL David GRANT O.C.

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Proteome Research, rok: 2019, ročník: 18, vydání: 2, DOI

2018

• ChannelsDB: database of biomacromolecular tunnels and pores

  PRAVDA Lukáš SEHNAL David SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka NAVRÁTILOVÁ Veronika TOUŠEK Dominik BERKA Karel OTYEPKA Michal KOČA Jaroslav

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2018, ročník: 46, vydání: D1, DOI

• Interactive 3D Macromolecular Structure Data Mining with MolQL and Litemol Suite

  SEHNAL David DESHPANDE M ROSE A PRAVDA Lukáš MIDLIK Adam SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka MIR S BERKA K VELANKAR S KOČA Jaroslav

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2018, druh: Konferenční abstrakty