RNDr. David Sehnal, Ph.D.

2014

• ValidatorDB: database of validation results for ligands and non-standard residues from the Protein Data Bank

  SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka JAISWAL Deepti SEHNAL David IONESCU Crina-Maria GEIDL Stanislav PRAVDA Lukáš HORSKÝ Vladimír WIMMEROVÁ Michaela KOČA Jaroslav

  Software

  Rok: 2014

• Web server for the rapid calculation of empirical atomic charges with QM accuracy

  GEIDL Stanislav SEHNAL David IONESCU Crina-Maria SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka PANT Purbaj KOČA Jaroslav

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2014, druh: Konferenční abstrakty

2013

• MOLE 2.0: advanced approach for analysis of biomacromolecular channels

  SEHNAL David SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka BERKA Karel PRAVDA Lukáš NAVRÁTILOVÁ Veronika BANÁŠ Pavel IONESCU Crina-Maria OTYEPKA Michal KOČA Jaroslav

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Cheminformatics, rok: 2013, ročník: 5, vydání: 39, DOI

• MOLE 2.0: Improved Approach for Analysis of Biomacromolecular Channels and Pores

  PRAVDA Lukáš SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka SEHNAL David BERKA Karel OTYEPKA Michal KOČA Jaroslav

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2013, druh: Další prezentace na konferencích

• Predicting pKa values from EEM atomic charges

  SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka GEIDL Stanislav IONESCU Crina-Maria SKŘEHOTA Ondřej BOUCHAL Tomáš SEHNAL David ABAGYAN Ruben A. KOČA Jaroslav

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Cheminformatics, rok: 2013, ročník: 5, vydání: 18, DOI

2012

• BH3-ONLY PROTEINS - FROM STRUCTURE TO FUNCTION

  IONESCU Crina-Maria KLÍMOVÁ Zuzana SEHNAL David SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka KOČA Jaroslav

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2012, druh: Další prezentace na konferencích

• MOLEonline 2.0: Interactive Web-based Analysis of Biomacromolecular Channels

  BERKA Karel HANÁK Ondřej SEHNAL David BANÁŠ Pavel NAVRÁTILOVÁ Veronika JAISWAL Deepti IONESCU Crina-Maria SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka KOČA Jaroslav OTYEPKA Michal

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2012, ročník: 40, vydání: W1, DOI

• Predicting pKa values of substituted phenols by QSPR models which employ EEM atomic charges

  GEIDL Stanislav SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka IONESCU Crina-Maria SKŘEHOTA Ondřej BOUCHAL Tomáš KUDERA Michal SEHNAL David RUBEN Abagyan KOČA Jaroslav

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2012, druh: Konferenční abstrakty

• SiteBinder: An improved approach for comparing multiple protein structural motifs

  SEHNAL David SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka HUBER Heinrich J. GEIDL Stanislav IONESCU Crina-Maria WIMMEROVÁ Michaela KOČA Jaroslav

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Chemical Information and Modeling, rok: 2012, ročník: 52, vydání: 2, DOI

2011

• Comparison of protein structural motifs – challenges and algorithms. Improved approach and case studies

  SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka SEHNAL David PRAVDA Lukáš OPPELT Jan IONESCU Crina-Maria GEIDL Stanislav KOČA Jaroslav

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty