Informace o projektu
Epigeneticky kontrolované změny exprese genů u nádorových onemocnění
- Kód projektu
- NC6987
- Období řešení
- 1/2002 - 12/2004
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo zdravotnictví ČR
- Výzkum a vývoj v oblasti Onkologie
- Fakulta / Pracoviště MU
- Fakulta informatiky
- Klíčová slova
- DNA-microarrays;cancer;chromosome structure;epigenetic regulation;cell differentiation
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba doc. RNDr. Stanislav Kozubek, DrSc.
- Odpovědná osoba MUDr. Zdeněk Kořístek, Ph.D.
- Odpovědná osoba prof. MUDr. Jan Žaloudík, CSc.
Pomocí technologie DNA-mikročipů budou stanoveny transkripční mapy u několika populací zdravých a nádorových buněk s různým stupněm progrese. Porovnáním transkripčních map se budeme snažit o nalezení kombinací genů, pomiňujících kancerogenezi. Dále bude opužita FISH u 3D fixovaných buněk a cytometrie s vysokým rozlišením ke zjištění struktury chromosomů v interfázním jádře. Změny ve struktuře oproti normální tkáni budou porovnány se změnami exprese. Bude učiněn závěr o míře souvislosti mezi strukturou a expresí v průběhu karcinogeneze. Tím můžeme získat možnost použití nové, levné metody k detekci onkogenní transformace specifické tkáně. Projekt přinese také zavedení techniky DNA-mikročípů na druhém pracovišti v ČR, což bude mít význam pro regionální rozvoj progresivních technologií.
Publikace
Počet publikací: 18
2005
-
Methylation of histones in myeloid leukemias as a potential marker of granulocyte abnormalities
Journal of Leukocyte Biology, rok: 2005, ročník: 77, vydání: 1
2004
-
Automated image analysis in fluorescence microscopy: From isolated cells to tissues and microarray images
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Colocalization of PML bodies and PML/RARalpha microspeckles with up- and down-regulated loci and changes of chromatin structure in APL leukemia cells
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Cytological study of DNA methylation and histone methylation patterns in human cell lines
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Different nuclear localization of aberrant and normal chromosome 8 homologues in intact or NaBt differentiated HT-29 cells
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
From Jenalumar to Ultrafast Microscopy of Living Cells
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Gene expression in colorectal carcinoma determined by cDNA microarrays using a combination of several evaluation approaches.
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Methylation of histone H3K9 in human blood cells and in granulocytes of patients with myeloid leukemia
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Nové možnosti v diagnostice kolorektálního karcinomu s využitím technologie cDNA mikročipů
Klinická onkologie, rok: 2004, ročník: 6/17, vydání: 6
-
Relationship of HP1 proteins to centromeric heterochromatin characterized by the presence of H3(K9) and absence of H3(K4) dimethylation
Biophysics of the Genome, rok: 2004