Informace o projektu
Epigeneticky kontrolované změny exprese genů u nádorových onemocnění
- Kód projektu
- NC6987
- Období řešení
- 1/2002 - 12/2004
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo zdravotnictví ČR
- Výzkum a vývoj v oblasti Onkologie
- Fakulta / Pracoviště MU
- Fakulta informatiky
- Klíčová slova
- DNA-microarrays;cancer;chromosome structure;epigenetic regulation;cell differentiation
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba doc. RNDr. Stanislav Kozubek, DrSc.
- Odpovědná osoba MUDr. Zdeněk Kořístek, Ph.D.
- Odpovědná osoba prof. MUDr. Jan Žaloudík, CSc.
Pomocí technologie DNA-mikročipů budou stanoveny transkripční mapy u několika populací zdravých a nádorových buněk s různým stupněm progrese. Porovnáním transkripčních map se budeme snažit o nalezení kombinací genů, pomiňujících kancerogenezi. Dále bude opužita FISH u 3D fixovaných buněk a cytometrie s vysokým rozlišením ke zjištění struktury chromosomů v interfázním jádře. Změny ve struktuře oproti normální tkáni budou porovnány se změnami exprese. Bude učiněn závěr o míře souvislosti mezi strukturou a expresí v průběhu karcinogeneze. Tím můžeme získat možnost použití nové, levné metody k detekci onkogenní transformace specifické tkáně. Projekt přinese také zavedení techniky DNA-mikročípů na druhém pracovišti v ČR, což bude mít význam pro regionální rozvoj progresivních technologií.
Publikace
Počet publikací: 18
2004
-
Topographic characterization of telomeres in healthy and various tumor cell lines determined in situ and in vivo
Rok: 2004, druh: Konferenční abstrakty
-
Topography of genetic loci in the nuclei of cells of colorectal carcinoma and adjacent tissue of colonic epithelium
Chromosoma, rok: 2004, ročník: 112, vydání: 5
2003
-
Cytogenetics and cytology of retinoblastomas
J Cancer Res. Clin.Oncol., rok: 2003, ročník: 129, vydání: 2
-
Nuclear and territorial topography of chromosome telomeres in human lymphocytes
Experimental Cell Research, rok: 2003, ročník: 289, vydání: 1
-
Study of the gene expression in malignant diseases by cDNA microarray technology
Biophysics of the Genome, rok: 2003
-
Topography of telomeres and structure of chromosome territories in human lymphocytes
Biophysics of the Genome, rok: 2003
2002
-
Nuclear topography and gene activity
Biophysics of the genome and its interactions, rok: 2002
-
Structure of the human genome: Experimental results and models
Biophysics of the genome and its interactions, rok: 2002