Informace o projektu
CERIT Scientific Cloud
(CERIT-SC)
- Kód projektu
- CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_013/0001802 (kod CEP: EF16_013/0001802)
- Období řešení
- 5/2017 - 6/2021
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- OP Výzkum, vývoj a vzdělávání (OP VVV)
- PO 1 Posilování kapacit pro kvalitní výzkum
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Ústav výpočetní techniky
- Mgr. Aleš Křenek, Ph.D.
- doc. Ing. RNDr. Barbora Bühnová, Ph.D.
- doc. RNDr. Jiří Filipovič, Ph.D.
- doc. Mouzhi Ge, Ph.D.
- Mgr. Samuel Gorta
- Mgr. Jan Horáček
- Ing. Jana Hozzová, Ph.D.
- Mgr. Kristián Katanik
- Mgr. Vojtěch Krajňanský
- Mgr. Aleš Křenek, Ph.D.
- RNDr. Martin Macák, Ph.D.
- Mgr. David Myška
- RNDr. Petra Němcová
- Mgr. et Mgr. Jaroslav Oľha
- Mgr. Marek Pastierik
- RNDr. Tomáš Raček, Ph.D.
- RNDr. Tomáš Rebok, Ph.D.
- Bruno Rossi, PhD
- Bc. Maksym Skoryk
- RNDr. Terézia Slanináková
- Mgr. Radim Šašinka
- Mgr. Matúš Štovčik
- Muhammad Usman, Ph.D.
- Mgr. Vladimír Višňovský
- WWW stránky projektu
- https://www.cerit-sc.cz/cs/
Projekt primárně představuje investiční část národní výzkumné infrastruktury CERIT-SC. Jeho cílem je tedy obnovit a případně rozšířit aktuální výpočetní a úložné kapacity i programové vybavení CERIT-SC tak, aby celá výzkumná infrastruktura (s kapacitou přes 5 tisíc jader a téměř 5 PB) mohla i v následujícím období plnit své poslání unikátního experimentálního zařízení pro výzkum a vývoj v oblasti flexibilních e-infrastruktur a pro rozsáhlé in-silico experimenty, realizované v úzké spolupráci s dalšími vědeckými disciplínami. Vlastní výzkumné aktivity CERIT-SC jsou primárně určovány potřebami vývoje vlastní e-infrastruktury a jejího pokročilého využití (plánování, akcelerace, návrh a optimalizace algoritmů, optimalizace infrastruktury, bezpečnost). Z tohoto vychází i návrh in-house podprojektů, které se zaměří na oblast optimalizace a akcelerace výpočtů (včetně využití GPU či Xeon Phi jako akcelerátory) a na zpracování velkých objemů dat (s cílem efektivního využití potenciálů virtualizované výpočetní a datové infrastruktury). Celkově projekt přispěje k posílení pozice MU jako unikátního národního a významného mezinárodního centra výzkumu a vývoje v oblasti e-infrastruktur.
Publikace
Počet publikací: 39
2023
-
CoPAS: the Modular Data Analytics Tool
Rok: 2023
2022
-
On bias, variance, overfitting, gold standard and consensus in single-particle analysis by cryo-electron microscopy
Acta Crystallographica Section D: Structural Biology, rok: 2022, ročník: 78, vydání: 4, DOI
-
Using hardware performance counters to speed up autotuning convergence on GPUs
Journal of Parallel and Distributed Computing, rok: 2022, ročník: 160, vydání: February, DOI
2021
-
4D-GRAPHS
Rok: 2021
-
Advances in Xmipp for Cryo–Electron Microscopy: From Xmipp to Scipion
Molecules, rok: 2021, ročník: 26, vydání: 20, DOI
-
Approximating deformation fields for the analysis of continuous heterogeneity of biological macromolecules by 3D Zernike polynomials
International Union of Crystallography Journals, rok: 2021, ročník: 8, vydání: 6, DOI
-
Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods
Structural Proteomics, rok: 2021, počet stran: 33 s.
-
Kernel Tuning Toolkit 2.0
Rok: 2021
-
Searching CUDA code autotuning spaces with hardware performance counters: data from benchmarks running on various GPU architectures
Data in Brief, rok: 2021, ročník: 39, vydání: December, DOI
2020
-
A benchmark set of highly-efficient CUDA and OpenCL kernels and its dynamic autotuning with Kernel Tuning Toolkit
Future Generation Computer Systems, rok: 2020, ročník: 108, vydání: July, DOI