Informace o projektu
Evoluce substrátové specifity u enzymů aktivních s xenobiotickými látkami
- Kód projektu
- IAA401630901
- Období řešení
- 1/2009 - 12/2013
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Akademie věd ČR
- Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména AV ČR
- Fakulta / Pracoviště MU
- Přírodovědecká fakulta
Hlavním cílem projektu je studium evoluce substrátové specifity mikrobiálních enzymů aktivních s xenobiotickými sloučeninami. Zvolený modelovým systém, halogenalkandehalogenasy, je vhodný k tomuto účelu vzhledem k aktivitě dehalogenas enzymů s biologicky špatně rozložitelnými sloučeninami, které se v biosféře nevyskytovaly před průmyslovou revolucí. Evoluce bude studována rekurzivně kvantitativním popisem substrátové specifity moderních halogenalkandehalogenas a srovnáním se specifitou předků těchto enzymů navržených fylogenetickou dedukcí a konstruovaných genovou syntézou. Konečným výsledkem této analýzy bude ohodnocení funkčního přesahu jednotlivých podrodin a podrobný popis molekulárních událostí vedoucích ke specializaci těchto enzumů umožňující účinný rozklad xenobiotických substrátů. Různé teoretické a experimentální přístupy budou použity k přípravě biologického materiálu a ke sběru dat nezbytných k testování alternativních evolučních hypotéz.
Publikace
Počet publikací: 67
2010
-
Effect of organic solvents on structure and function of haloalkane dehalogenases
Rok: 2010, druh: Další prezentace na konferencích
-
Enantioselectivity of Haloalkane Dehalogenases and its Modulation by Surface Loop Engineering
Angewandte Chemie International Edition, rok: 2010, ročník: 49, vydání: 35
-
Engineering of Biocatalysts by Modification of Access Tunnels
Rok: 2010, druh: Vyžádané přednášky
-
HOTSPOT WIZARD: NÁSTROJ PRO INŽENÝRSTVÍ ENZYMŮ
Rok: 2010, druh: Další prezentace na konferencích
-
Increasing activity of bacterial biocatalyst with toxic anthropogenic substrate using methods of protein engineering.
Rok: 2010, druh: Další prezentace na konferencích
-
Structure and activity of haloalkane dehalogenases in organic co-solvents
Rok: 2010, druh: Vyžádané přednášky
-
Systems biology at work
Current Opinion in Biotechnology, rok: 2010, ročník: 21, vydání: 21
2009
-
.: Keyhole-Lock-Key Model: Engineering of Tunnels in Proteins with Buried Active Sites
Rok: 2009, druh: Vyžádané přednášky
-
Computer-Assisted Engineering of Biomolecules
Rok: 2009, druh: Vyžádané přednášky
-
Engineering of tunnels in proteins with buried active sites
Rok: 2009, druh: Vyžádané přednášky