Informace o projektu
Evoluce substrátové specifity u enzymů aktivních s xenobiotickými látkami
- Kód projektu
- IAA401630901
- Období řešení
- 1/2009 - 12/2013
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Akademie věd ČR
- Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména AV ČR
- Fakulta / Pracoviště MU
- Přírodovědecká fakulta
Hlavním cílem projektu je studium evoluce substrátové specifity mikrobiálních enzymů aktivních s xenobiotickými sloučeninami. Zvolený modelovým systém, halogenalkandehalogenasy, je vhodný k tomuto účelu vzhledem k aktivitě dehalogenas enzymů s biologicky špatně rozložitelnými sloučeninami, které se v biosféře nevyskytovaly před průmyslovou revolucí. Evoluce bude studována rekurzivně kvantitativním popisem substrátové specifity moderních halogenalkandehalogenas a srovnáním se specifitou předků těchto enzymů navržených fylogenetickou dedukcí a konstruovaných genovou syntézou. Konečným výsledkem této analýzy bude ohodnocení funkčního přesahu jednotlivých podrodin a podrobný popis molekulárních událostí vedoucích ke specializaci těchto enzumů umožňující účinný rozklad xenobiotických substrátů. Různé teoretické a experimentální přístupy budou použity k přípravě biologického materiálu a ke sběru dat nezbytných k testování alternativních evolučních hypotéz.
Publikace
Počet publikací: 67
2013
-
Immobilization of Haloalkane Dehalogenase LinB from Sphingobium japonicum UT26 for Biotechnological Applications
Journal of Biocatalysis & Biotransformation, rok: 2013, ročník: 2, vydání: 2
-
Interaction of Organic Solvents with Protein Structures at Protein-Solvent Interface
Journal of Molecular Modeling, rok: 2013, ročník: 19, vydání: 11, DOI
-
Miniaturizovaný příruční fluorimetr
Rok: 2013
-
Novosphingobium barchaimii sp nov., isolated from hexachlorocyclohexane-contaminated soil
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, rok: 2013, ročník: 63, vydání: Part 2, DOI
-
Organic Co-solvents Affect Activity, Stability and Enantioselectivity of Haloalkane Dehalogenases
Biotechnology Journal, rok: 2013, ročník: 8, vydání: 6, DOI
-
PredictSNP 1.0
Rok: 2013
-
Rekombinantní enzym haloalkan dehalogenáza DatA.
Rok: 2013
-
Rekombinantní enzym haloalkan dehalogenáza DspA.
Rok: 2013
-
Software tools for identification, visualization and analysis of protein tunnels and channels
BIOTECHNOLOGY ADVANCES, rok: 2013, ročník: 31, vydání: 1, DOI
-
Sphingobium baderi sp nov., isolated from a hexachlorocyclohexane dump site
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, rok: 2013, ročník: 63, vydání: Part 2, DOI