Informace o projektu
Delta podjednotka RNA polymerázy z Gram pozitivních bakterií
(DELTA)
- Kód projektu
- GA204/09/0583
- Období řešení
- 1/2009 - 12/2012
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
- Klíčová slova
- RNA polymeráza
- Spolupracující organizace
-
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba Mgr. Libor Krásný, Ph.D.
Pro účinný boj s bakteriálními nemocemi a infekcemi je nezbytná znalost molekulárních mechanismů těchto organismů. Bakteriální RNA polymeráza (RNAP) je esenciální vícepodjednotkový enzym. Na rozdíl od extenzivně studované RNAP z gram negativních baktérií, RNAP z gram pozitivních bakterií obsahuji delta podjednotku. Její role v v buňce není plně objasněna. Navrhujeme provést strukturní, genetické a biochemické studie této podjednotky a definovat tak její roli v regulaci genové exprese. Navrhujeme stanovit 3D strukturu delta podjednotky, určit její pozici na RNAP a za pomoci těchto nových znalostí definovat její fyziologickou roli v buňce.
Publikace
Počet publikací: 19
2013
-
Structural Study of the Partially Disordered Full-Length delta Subunit of RNA Polymerase from Bacillus subtilis
ChemBioChem, rok: 2013, ročník: 14, vydání: 14, DOI
-
The Delta Subunit of RNA Polymerase Is Required for Rapid Changes in Gene Expression and Competitive Fitness of the Cell
Journal of Bacteriology, rok: 2013, ročník: 195, vydání: 11, DOI
2012
2011
-
5D 13C-detected experiments for backbone assignment of unstructured proteins with a very low signal dispersion
Journal of Biomolecular NMR, rok: 2011, ročník: 50, vydání: 1, DOI
-
Complementation of 3D structure of delta subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis with description of internal motions in terms of reduced spectral density mapping
MATERIALS STRUCTURE, rok: 2011, ročník: 18, vydání: 1
-
Crystallization and structure determination of delta-subunit of RNApolymerase
Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty
-
NMR study of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria
Rok: 2011, druh: Další prezentace na konferencích
-
Structural analysis of delta-subnit of RNA-polymerase by X-ray
Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty
-
Study of RNA polymerase delta subunit unique for gram-positive bacteria
Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty
-
The X-ray structure versus NMR structure of delta-subunit of RNA-polymerase
Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty