doc. RNDr. Jiří Filipovič, Ph.D.

2024

• A methodology for comparing optimization algorithms for auto-tuning

  FLORIS-JAN Willemsen SCHOONHOVEN Richard FILIPOVIČ Jiří TORRING Jacob O. NIEUWPOORT Rob van WERKHOVEN Ben van

  Článek v odborném periodiku

  Future Generation Computer Systems, rok: 2024, ročník: 109, vydání: October 2024, DOI

• Efficient Code Region Characterization Through Automatic Performance Counters Reduction Using Machine Learning Techniques

  HARUTYUNYAN Suren CÉSAR Eduardo SIKORA Anna FILIPOVIČ Jiří DUTTA Akash JANNESARI Ali ALCARAZ Jordi

  Článek ve sborníku

  European Conference on Parallel Processing, rok: 2024

• Towards Dynamic Autotuning of SpMV in CUSP Library

  DEMEK Miroslav FILIPOVIČ Jiří

  Článek ve sborníku

  IEEE International Parallel and Distributed Processing Symposium Workshops (IPDPSW), rok: 2024

2023

• Estimating conformational landscapes from Cryo-EM particles by 3D Zernike polynomials

  HERREROS David LEDERMAN Roy R. KRIEGER James M. JIMÉNEZ-MORENO Amaya MARTÍNEZ Marta MYŠKA David STŘELÁK David FILIPOVIČ Jiří SORZANO Carlos O. S. CARAZO José M.

  Článek v odborném periodiku

  Nature Communications, rok: 2023, ročník: 14, vydání: 1, DOI

• Kernel Tuning Toolkit

  PETROVIČ Filip FILIPOVIČ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  SoftwareX, rok: 2023, ročník: 22, vydání: neuveden, DOI

• pyCaverDock: Python implementation of the popular tool for analysis of ligand transport with advanced caching and batch calculation support

  VÁVRA Ondřej BERANEK Jakub ŠTOURAČ Jan SURKOVSKY Martin FILIPOVIČ Jiří DAMBORSKÝ Jiří MARTINOVIC Jan BEDNÁŘ David

  Článek v odborném periodiku

  Bioinformatics, rok: 2023, ročník: 39, vydání: 8, DOI

• Towards a Benchmarking Suite for Kernel Tuners

  TORRING Jacob O BEN van Werkhoven PETROVIČ Filip WILLEMSEN Floris-Jan FILIPOVIČ Jiří ELSTER Anne C

  Článek ve sborníku

  2023 IEEE International Parallel and Distributed Processing Symposium Workshops (IPDPSW), rok: 2023

• Umpalumpa: a framework for efficient execution of complex image processing workloads on heterogeneous nodes

  STŘELÁK David MYŠKA David PETROVIČ Filip POLÁK Jan OĽHA Jaroslav FILIPOVIČ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Computing, rok: 2023, ročník: 105, vydání: 11, DOI

• ZART: A Novel Multiresolution Reconstruction Algorithm with Motion-blur Correction for Single Particle Analysis

  HERREROS David KISKA Jakub RAMÍREZ-APORTELA Erney FILIPOVIČ Jiří CARAZO José María SORZANO Carlos Oscar

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Molecular Biology, rok: 2023, ročník: 435, vydání: 9, DOI

2022

• Improving ligand transport trajectory within flexible receptor in CaverDock

  NĚMCOVÁ Petra HOZZOVÁ Jana FILIPOVIČ Jiří

  Článek ve sborníku

  SAC '22: Proceedings of the 37th ACM/SIGAPP Symposium on Applied Computing, rok: 2022