Informace o projektu
Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
- Kód projektu
- MSM 143300002
- Období řešení
- 1/1999 - 12/2004
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Výzkumné záměry
- Fakulta / Pracoviště MU
- Fakulta informatiky
- Klíčová slova
- image analysis; image processing; segmentation; preprocessing; deconvolution; 3D analysis; 3D reconstruction; mathematical morphology; parallel computing; parallel algorithms; optical microscopy; confocal microscopy; automation; automated microscopy
Cíl: Cílem projektu je výzkum v oblasti počítačové analýzy mikroskopického obrazu, v oblasti automatizace procesu snímání a on-line analýzy obrazu a aplikace získaných poznatků v praxi. Návrh předpokládá jak pokračování v běžícím výzkumu struktury buněčného jádra s klinickým uplatněním při diagnostice a prevenci leukémií a jiných nádorových onemocnění, tak rozšíření výzkumu na jiné aplikace počítačové analýzy mikroskopického obrazu, biomedicínské i průmyslové. Obsah: Zkoumány budou zejména algoritmy předzpracování a segmentace obrazu s důrazem na dekonvoluci 3D obrazu, na operace matematické morfologie a na 3D rekonstrukci obrazu ze série 2D obrazových řezů. Intenzivní výzkum bude veden také v oblasti paralelních algoritmů analýzy obrazu a paralelizace vybraných algoritmů na víceprocesorových pracovních stanicích s využitím vybavení Superpočítačového centra MU.Vzhledem ke značné interdisciplinárnosti,bude udržována těsná spolupráce s kolegy ze špičkových pracovišť v Oxfordu,Heidelbergu a dalších míst.
Výsledky
Cílem projektu je výzkum v oblasti počítačové analýzy mikroskopického obrazu, v oblasti automatizace procesu snímání a on-line analýzy obrazu a aplikace získaných poznatků v praxi.
Publikace
Počet publikací: 88
2004
-
Biophysics of the Genome
Rok: 2004, druh: Editorství tématického sborníku
-
Clustering of genes with similar regulation patterns during monocyte and granulocyte differentiation of HL-60 cells
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Cytological study of DNA methylation and histone methylation patterns in human cell lines
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Fast Marching 3D Reconstruction of Interphase Chromosomes
Computer Vision and Mathematical Methods in Medical and Biomedical Image Analysis, rok: 2004
-
Gene expression in colorectal carcinoma determined by cDNA microarrays using a combination of several evaluation approaches.
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
High-Resolution Cytometry Network Project: Client/Server System for 3D Optical Microscope Data Storage and Analysis
2nd International Symposium on 3D Data Processing, Visualization, and Transmission, rok: 2004
-
Image analysis of the movement of sub-cellular structures
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
In vivo imaging of cell interior using automated high-resolution cytometry
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Rapid Image Acquisition of Living Cells and its Limits
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Topographic characterization of telomeres in healthy and various tumor cell lines determined in situ and in vivo
Rok: 2004, druh: Konferenční abstrakty