Informace o projektu
Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
- Kód projektu
- MSM 143300002
- Období řešení
- 1/1999 - 12/2004
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Výzkumné záměry
- Fakulta / Pracoviště MU
- Fakulta informatiky
- Klíčová slova
- image analysis; image processing; segmentation; preprocessing; deconvolution; 3D analysis; 3D reconstruction; mathematical morphology; parallel computing; parallel algorithms; optical microscopy; confocal microscopy; automation; automated microscopy
Cíl: Cílem projektu je výzkum v oblasti počítačové analýzy mikroskopického obrazu, v oblasti automatizace procesu snímání a on-line analýzy obrazu a aplikace získaných poznatků v praxi. Návrh předpokládá jak pokračování v běžícím výzkumu struktury buněčného jádra s klinickým uplatněním při diagnostice a prevenci leukémií a jiných nádorových onemocnění, tak rozšíření výzkumu na jiné aplikace počítačové analýzy mikroskopického obrazu, biomedicínské i průmyslové. Obsah: Zkoumány budou zejména algoritmy předzpracování a segmentace obrazu s důrazem na dekonvoluci 3D obrazu, na operace matematické morfologie a na 3D rekonstrukci obrazu ze série 2D obrazových řezů. Intenzivní výzkum bude veden také v oblasti paralelních algoritmů analýzy obrazu a paralelizace vybraných algoritmů na víceprocesorových pracovních stanicích s využitím vybavení Superpočítačového centra MU.Vzhledem ke značné interdisciplinárnosti,bude udržována těsná spolupráce s kolegy ze špičkových pracovišť v Oxfordu,Heidelbergu a dalších míst.
Výsledky
Cílem projektu je výzkum v oblasti počítačové analýzy mikroskopického obrazu, v oblasti automatizace procesu snímání a on-line analýzy obrazu a aplikace získaných poznatků v praxi.
Publikace
Počet publikací: 88
2002
-
Chromatin modifications determined in retinoblastoma
Rok: 2002, druh: Konferenční abstrakty
-
Nuclear structure and gene activity in human differentiated cells
Journal of Structural Biology, rok: 2002, ročník: 139, vydání: 2
-
Nuclear topography and gene activity
Biophysics of the genome and its interactions, rok: 2002
-
Optimisation of FISH Methodology for the Study of 3D Structure of Cell Nuclei Using Micro Axial Tomography
Biophysics of the Genome and Its Interactions, rok: 2002
-
Spatial distribution of centromeric and subtelomeric DNA sequences in interphase nuclei of human Go and stimulated lymphocytes
Biophysics of the genome and its interactions, rok: 2002
-
Structure of the human genome: Experimental results and models
Biophysics of the genome and its interactions, rok: 2002
-
The 3D structure of human chromosomes in cell nuclei
Chromosome Research, rok: 2002, ročník: 10, vydání: 7
-
The power of computerized light microscopy
Imaging & Microscopy, rok: 2002, ročník: 4, vydání: 2
2001
-
Combined confocal and wide-field high-resolution cytometry of FISH-stained cells
Cytometry, rok: 2001, ročník: 45, vydání: 1
-
Cytogenetics of Retinoblastoma
Rok: 2001, druh: Konferenční abstrakty